細(xì)胞中基因的表達(dá)是嚴(yán)格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細(xì)胞類型和基因表達(dá)具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細(xì)胞懸液制備的過程中破壞了細(xì)胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題，其以點陣形式記錄組織切片細(xì)胞的空間信息，在保留組織形態(tài)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，獲得細(xì)胞/基因的空間表達(dá)特異性。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序。上海10X Chromium X單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是在單細(xì)胞水平上高通量測序分析基因表達(dá)譜的技術(shù)，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性，組織解離后，單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細(xì)胞，基于每個細(xì)胞分別建庫測序，獲得單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類型，可以在不同樣本間從細(xì)胞類型的組成和豐度角度進行比較，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性。而2021年橫空出世的10XGenomicsChromiumX平臺實現(xiàn)了單塊chip上的百萬級別通量的細(xì)胞捕獲，系統(tǒng)實現(xiàn)16個通道同時運行，每個通道可捕獲2000-20000個細(xì)胞（不混樣），并支持原ChromiumController體統(tǒng)外的多種細(xì)胞捕獲百萬級別通量實驗，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型和適配大規(guī)模單細(xì)胞研究。青島烈冰科技單細(xì)胞測序烈冰專精單細(xì)胞多組學(xué)測序領(lǐng)域。

10XGenomics是一種基于drop的微流控技術(shù)，液體在配套芯片中的微管道中流動，因此細(xì)胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制，微流體通道的直徑約為50~60um，因此捕獲細(xì)胞的直徑不能超過40um。當(dāng)細(xì)胞直徑過大時，容易出現(xiàn)管道堵塞，造成GEM生成失敗，對于神經(jīng)科學(xué)研究和心血管疾病研究的老師而言，準(zhǔn)備采用單細(xì)胞技術(shù)用于課題研究的時候，往往會遇到一個尷尬的問題，就是目標(biāo)細(xì)胞，例如神經(jīng)元細(xì)胞、成熟心肌細(xì)胞由于體積過大，不適用于10X單細(xì)胞技術(shù)。其中神經(jīng)元細(xì)胞的直徑很大，直接超過了芯片中管道的直徑，雖然心肌細(xì)胞直徑低于50um，但是成熟心肌細(xì)胞的長度很長，有可能堵塞通道造成實驗失敗，這也是為什么現(xiàn)在很多已發(fā)表的心臟單細(xì)胞文章，主要研究方向是心臟發(fā)育的原因了，主要還是因為未發(fā)育成熟的心肌細(xì)胞比較小，不會出現(xiàn)堵塞管道的風(fēng)險。因此可以考慮組織解離后過40um濾網(wǎng)，過濾掉大細(xì)胞，避免出現(xiàn)管道堵塞、實驗失敗的風(fēng)險。此種方案的缺點是大細(xì)胞被過濾掉，丟失相關(guān)細(xì)胞數(shù)據(jù)；另外組織解離獲得高質(zhì)量細(xì)胞懸液以后，繼續(xù)做細(xì)胞裂解抽細(xì)胞核，開展細(xì)胞核測序。具體可訪問烈冰官網(wǎng)給我們留言，烈小冰將安排專業(yè)技術(shù)為您詳細(xì)解答。

樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化，在對細(xì)胞進行清洗和計數(shù)后，單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上，直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下，一旦制備好樣本，應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而，您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì)，因為這可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時間，以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如，有些細(xì)胞（如PBMC）如果在冰上放置一段時間，它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離，增加了堵塞的風(fēng)險，而且每個團塊被當(dāng)成單細(xì)胞計數(shù)，又降低了細(xì)胞計數(shù)的準(zhǔn)確性。此外，有些細(xì)胞更加粘稠，形成團塊的速度更快。對于這些細(xì)胞，必須盡量減少制備和使用之間的時間差烈冰科技已建立了多種國際和國內(nèi)主流的高通量測序?qū)嶒炂脚_。

單細(xì)胞多組學(xué)提升見解基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強大之處，因為它能夠了解同一單細(xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來樣本的真實視圖。烈冰2021年強勢引進的10xGenomicsChromium單細(xì)胞平臺能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同，單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實驗，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性，因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系。單細(xì)胞測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務(wù)讓您的醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。10X Genomics單細(xì)胞測序服務(wù)公司

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細(xì)胞計數(shù)和活力評估在評估樣本質(zhì)量時，需要在細(xì)胞清洗和過濾之后測定細(xì)胞活力，這一點至關(guān)重要。測定細(xì)胞活力有許多種方法，烈冰多年單細(xì)胞測序經(jīng)驗發(fā)現(xiàn)臺盼藍(lán)法在鑒定活細(xì)胞與死細(xì)胞的比例時效果很好。細(xì)胞計數(shù)的準(zhǔn)確性以及目標(biāo)回收量和實際回收量之間的一致性，取決于我們了解樣本中有多少個細(xì)胞。一旦過濾和清洗完成，可采用細(xì)胞計數(shù)設(shè)備（如血球計數(shù)器或自動細(xì)胞計數(shù)儀）進行定量。這些設(shè)備不但能提供準(zhǔn)確的細(xì)胞計數(shù)，還能計算出向微流體芯片上樣適量細(xì)胞所需的細(xì)胞懸液體積。上海10X Chromium X單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析

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