單細胞測序技術(shù)的不斷發(fā)展解決了以往群體細胞組學分析面臨的兩個瓶頸:一是大量細胞的混合測序會掩蓋細胞間的異質(zhì)性;二是傳統(tǒng)的測序技術(shù)需要大量的細胞作為起始,細胞數(shù)目稀有的樣品則難以研究.利用單細胞測序方法不僅能夠揭示組織中的細胞類型和稀有亞群、細胞狀態(tài)和命運的變化,還可以研究細胞數(shù)稀有的珍貴樣品,從而幫助人們理解發(fā)育、衰老和疾病發(fā)展的機制。隨著單細胞轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀遺傳組、蛋白組等各組學測序技術(shù)的快速發(fā)展,研究者開始將它們相互組合,使得單個細胞或同類細胞的多個組學數(shù)據(jù)能夠聯(lián)合分析.因此,利用單細胞多組學技術(shù)能夠更有效地研究細胞在特定時空狀態(tài)下各組學間的復雜聯(lián)系,從而揭示細胞狀態(tài)和命運調(diào)控的分子機制。單一的轉(zhuǎn)錄本研究不能體現(xiàn)生命進程的變化,因此多組學聯(lián)合分析成為解析生命進程的有力工具。西安烈冰生物單細胞多組學測序價格
隨著單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(scRNA-Seq)的蓬勃發(fā)展,其在在胚胎發(fā)育,腫瘤細胞異質(zhì)性,免疫細胞轉(zhuǎn)化等多方面屢建奇功,但是由于細胞形態(tài)的不同和單細胞制備中細胞敏感性的差異等因素影響,scRNA-Seq在數(shù)據(jù)分析時可能會出現(xiàn)細胞類型占比失真,個別細胞類型丟失等情況。為了克服單細胞測序技術(shù)的局限性,單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(snRNA-Seq)應(yīng)運而生,snRNA-Seq可利用凍存組織直接制備單細胞核進行轉(zhuǎn)錄組測序,不僅克服了細胞形態(tài)差異致使的細胞捕獲差異,還克服了單細胞測序必須使用新鮮樣本的多個局限性。武漢烈冰生物單細胞多組學測序價格分子檢測型單細胞多組學測序技術(shù)大多數(shù)以轉(zhuǎn)錄 組測序為重點。
未來,單細胞多組學測序技術(shù)的發(fā)展,一方面將集中在對現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化和新方法的開發(fā).現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化不僅包括建庫手段、測序技術(shù)和算法工具等方面,還包括優(yōu)化實驗設(shè)計、自動化實驗流程以及提升實驗效率.為了更好地檢測到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物、化學和物理等多學科中尋找解決方案.此外,新的計算方法和分析工具能幫助研究者越過一些實驗限制,發(fā)現(xiàn)更多新奇的生物過程.例如,擬時序分析(pseudotimetrajectory)將有助于人們理解早期胚胎發(fā)育的細胞分化軌跡.新方法則可以更多地關(guān)注目前未能檢測到的一些重要的基因表達調(diào)控層面,如DNA三維結(jié)構(gòu)、非編碼RNA和胞內(nèi)蛋白等.另一方面,目前的單細胞多組學測序技術(shù)發(fā)展勢頭強勁,研究者不斷研發(fā)并豐富著單細胞測序工具箱,各種組學方法百家爭鳴.未來,研究者需要從眾多相似的方法中篩選出一些穩(wěn)定、通用、成本低、可商業(yè)化的方法,并進一步擴大其實際應(yīng)用范圍。
烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉(zhuǎn)分析工具,構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程;精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞測序分析結(jié)果,詳細深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后,就進入了空轉(zhuǎn)的第二步,去進行Spot的Cluster的過程,熟悉單細胞測序的研究者知道,Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype(當然分情況也會有不同)。而在空轉(zhuǎn)中,也正是由于前面提到了細胞的非單一性,導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型,而應(yīng)該認為是具有相同細胞組成的點陣區(qū)域,或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。分子檢測型單細胞多組學測序技術(shù)中也有一些集 中于探究單細胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。
相對于Smart-Seq技術(shù)在細胞數(shù)量上的問題,10X平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細胞量,這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,這兩種技術(shù)對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。同時依托Random Cell Label技術(shù),使得其對于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等設(shè)備存在的Index hooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,影響幾乎可以忽略不計(10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結(jié)果,顯示無影響。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。西安scRNA單細胞多組學測序服務(wù)
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