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溫州烈冰單細胞多組學多組學測序

來源: 發(fā)布時間:2022-08-22

烈冰科技作為國內同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗,實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰(zhàn)總結搭建出不同的數據預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大數據平臺能有效支撐生命科學研究、醫(yī)療健康等領域對大數據分析的需求。完備的高通量測序實驗平臺,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數字切片掃描儀等,配合一支來自海內外名校、多學科交叉型的高素質綜合團隊,為您的科學研究保駕護航。在單細胞轉錄組領域,將轉錄組與蛋白質結合的代表性例子只有單細 胞RNA測序方法。溫州烈冰單細胞多組學多組學測序

單細胞技術讓我們在基因組學、表觀基因組學、轉錄組學和蛋白質組學等層面上解析了許多錯綜復雜的生命密碼。隨著科技的進步,我們發(fā)現整合多個組學的信息可以更仔細地觀察細胞之間的可變性,更清楚地識別特定細胞及其功能。單細胞多組學在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重大生命科學領域方面的應用也將越來越廣。單細胞技術從 2009 年發(fā)展到現在,研究范圍不再局限于轉錄組,而是擴展到了基因組、免疫組、表觀組、蛋白組等多組學水平。成都高通量測序單細胞多組學測序服務單細胞多組學數據整合的一大挑戰(zhàn)在于不同組學的特征空間存在差異。

BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng),可以對不同熒光標記的細胞進行檢測并計數。在進行質量評估之前,首先要將細胞的培養(yǎng)體系更換成上機所需的Buffer。在這個過程中,需要進行多次離心、重懸操作,烈冰Novelbio單細胞實驗團隊推薦采用水平轉子離心機來進行這步操作。這種離心機可以有效減少細胞在多次更換Buffer過程中的損失,尤其是對于細胞量較少的樣本來說,顯得非常有必要。更換完Buffer之后,還需要將細胞進行過篩操作,去除較大的細胞團,獲得較為純凈的單細胞懸液。

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性??臻g轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況??臻g轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。單細胞多組學測序技術是在單細胞分辨率下精確分析細胞異質性和基因調控網絡的新技術。

單細胞多組學技術優(yōu)勢:1. 構建蛋白質數據庫,大幅度提高蛋白質鑒定數量;2. 不同層面表達水平分析,構建表達“全景圖”;3. 多組學交叉驗證:深層次挖掘其中調控機制;4. 對基因突變信息在蛋白水平上進行驗證;5.精細醫(yī)療:實現genomics到protegenomics的轉變。生物領域各個研究方面,1. 農林領域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護研究等;2. 畜牧業(yè):肉類及乳品質研究,致病機理研究等;3. 基礎醫(yī)學、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型等;4. 生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發(fā)等;5. 微生物領域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;6. 海洋水產:漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產品安全等;7. 生物能源、環(huán)境科學領域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產,環(huán)境危定風險評估研究等;8.食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。利用單細胞多組學技術能夠更有效地研究細 胞在特定時空狀態(tài)下各組學間的復雜聯(lián)系。武漢scRNA單細胞多組學平臺

單細胞多組學技術可在同一細胞中捕獲分析兩種以上的組學信息,包括轉錄組、基因組、表觀基因組、蛋白組等。溫州烈冰單細胞多組學多組學測序

2016年發(fā)表的DR-seq和G&T-seq技術,實現在單細胞內同時進行基因組和轉錄組的測序分析,使得研究人員能夠在分析細胞間基因組差異和基因表達異質性的同時,進一步理解基因組序列差異、拷貝數變異與轉錄組異質性之間的關系.隨后在同一個單細胞內,基于轉錄組、染色質可及性、染色質構象、DNA拷貝數、DNA甲基化、蛋白質豐度或者空間狀態(tài)等整合分析的多組學方法也相繼出現。相較于利用不同的單細胞單組學測序方法從一類細胞中分別獲取轉錄組、基因組、表觀遺傳組等進行分析,單細胞多組學測序技術可以從同一個單細胞中同時獲取多種組學數據,可以更好地反映細胞在特定狀態(tài)下各組學間的關聯(lián)以及復雜的分子調控網絡。溫州烈冰單細胞多組學多組學測序

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