對于單細胞測序而言，常常需要先構建細胞圖譜，在此基礎上再開展后續(xù)各項分析，并且數(shù)據(jù)分析時以細胞聚類（cell cluster）為討論對象，而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象，因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格，但是單細胞測序，特別是目的為圖譜研究時，需要通過提高樣本復雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構建某一疾病類型、群體細胞圖譜信息。因此，單細胞測序?qū)嶒炘O計時首先需要保證生物學重復，不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫、測序，以保證捕獲到足夠的細胞數(shù)，單個樣本分別捕獲細胞時，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準確性。目前單細胞多組學技術仍然處于技術探索及高通量開發(fā)階段,但應用單細胞多組學分析是研究發(fā)展的必然趨勢。北京scRNA單細胞多組學商業(yè)化服務

當下，單細胞測序已經(jīng)廣泛應用于多種疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件，如疾病從輕癥病變向惡性的轉化、惡性向轉移病變的發(fā)展，以及疾病對多種藥物的反應等等。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術，其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現(xiàn)在一個組織區(qū)域中他們會互相影響或者轉化么？免疫研究中，兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關系會生效么？西安烈冰單細胞多組學測序服務烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺，不依賴已有物種信息，可研究非模式物種，針對不同平臺的數(shù)據(jù)，制定多套流程。

烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉分析工具，構建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程；精心研發(fā)空轉結果瀏覽器，可同步展示空間轉錄組與單細胞測序分析結果，詳細深入地解析空間轉錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后，就進入了空轉的第二步，去進行Spot的Cluster的過程，熟悉單細胞測序的研究者知道，Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype（當然分情況也會有不同）。而在空轉中，也正是由于前面提到了細胞的非單一性，導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型，而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區(qū)域，或者說是近似的組織結構區(qū)域。

相對于Smart-Seq技術在細胞數(shù)量上的問題，10X平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細胞量，這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此，這兩種技術對于基于基因表達進行準確細胞分型上，無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說，都會更實用。同時依托Random Cell Label技術，使得其對于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等設備存在的Index hooping現(xiàn)象，相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說，影響幾乎可以忽略不計（10X Genomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結果，顯示無影響。未來，單細胞多組學測序技術的策略會繼續(xù)向轉錄組結合其他多個組學的三組學甚至四組學方向發(fā)展。

機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時，往往會經(jīng)歷轉錄重組，導致一些基因被“沉默”，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉化和變化進行描述。單細胞組學技術方法的不斷 發(fā)展和改進, 為單細胞層級的多組學整合分析奠定了 基礎。南京烈冰單細胞多組學測序服務公司

為了能深入分析和理解細胞狀態(tài)和命運決定的機制, 將單細胞各組學技術結合在一起的單細胞多組學技術產(chǎn)生。北京scRNA單細胞多組學商業(yè)化服務

如在現(xiàn)有研究方法基礎上，進行特定亞細胞區(qū)域的蛋白質(zhì)組學、相互作用蛋白質(zhì)組學以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質(zhì)組學的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認識與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細胞蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜研究方法的不斷發(fā)展，單細胞分析方法的靈敏度、蛋白質(zhì)的覆蓋度、細胞通量、空間分辨率以及多組學的兼容能力會不斷突破我們的認知極限。更重要的是，單細胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重大生命科學領域方面的應用將會越來越大。北京scRNA單細胞多組學商業(yè)化服務

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