機體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況,構(gòu)建細胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。BD Scanner,是您實驗過程的又一雙眼睛,實時監(jiān)測,精細質(zhì)控。廣東BD單細胞實驗平臺
基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強大之處,因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息,那么單細胞多組學(xué)提供了同一細節(jié)的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰自2019年引進的BDRhapsody單細胞平臺以來,能夠從同一單細胞中讀取細胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同,單細胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實驗,也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學(xué)準確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系。杭州scRNA單細胞測序服務(wù)公司烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。
由于高通量測序?qū)嶒灧椒ㄏ嚓P(guān)的測序成本,使得單細胞實驗往往非常昂貴,烈冰生物BDRhapsody單細胞測序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺搭建前,我們測試評估了BDRhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BDRhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序(每個細胞月8700個讀數(shù))。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細胞的上樣條件下,每個細胞中,來自每個細胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠,這表明微孔之間的串擾非常小,在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在15000個細胞下小于5%。
烈冰生物單細胞測序服務(wù)體系,不僅提供10XGenomics和BDRhapsody兩大國際認可的單細胞實驗平臺,在“附加”產(chǎn)品上,我們提供BDFACSMelody流式細胞儀,滿足您對特殊細胞類型的富集需求,自主研發(fā)的Panocell單細胞捕獲芯片,可兼容BD平臺全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細胞多組學(xué)解決方案。從細胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測試劑盒,生物信息分析工具,和在線大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、精簡方案和專業(yè)團隊技術(shù)支持,烈冰生物可為您提供用于單細胞多組學(xué)甚至到空間轉(zhuǎn)錄組測序的各種工具,助您加速科研探索之旅。助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息;助力醫(yī)療健康時代!
細胞計數(shù)和活力評估在評估樣本質(zhì)量時,需要在細胞清洗和過濾之后測定細胞活力,這一點至關(guān)重要。測定細胞活力有許多種方法,烈冰多年單細胞測序經(jīng)驗發(fā)現(xiàn)臺盼藍法在鑒定活細胞與死細胞的比例時效果很好。細胞計數(shù)的準確性以及目標回收量和實際回收量之間的一致性,取決于我們了解樣本中有多少個細胞。一旦過濾和清洗完成,可采用細胞計數(shù)設(shè)備(如血球計數(shù)器或自動細胞計數(shù)儀)進行定量。這些設(shè)備不但能提供準確的細胞計數(shù),還能計算出向微流體芯片上樣適量細胞所需的細胞懸液體積。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。湖北BD單細胞實驗服務(wù)
高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。廣東BD單細胞實驗平臺
烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。廣東BD單細胞實驗平臺
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