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青島BD單細(xì)胞多組學(xué)平臺

來源: 發(fā)布時間:2022-09-17

烈冰生信團(tuán)隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入genelist構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省您的工作時間并提升整體工作效率。單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)整合了單細(xì)胞各個組學(xué)特征, 提供了揭示細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及其互動關(guān)系的機(jī)會。青島BD單細(xì)胞多組學(xué)平臺

轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)都是獲得基因表達(dá)情況的重要工具,從生物學(xué)角度上看,轉(zhuǎn)錄組表示了基因表達(dá)的中間狀態(tài),可以反映諸如轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的機(jī)理;而蛋白質(zhì)是生物體直接的功能執(zhí)行者,因而對其表達(dá)水平的研究有著不可替代的優(yōu)勢。要探究生物體疾病機(jī)理、脅迫機(jī)制,精確研究重要基因的表達(dá)模式和調(diào)控機(jī)理,只有聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)表達(dá)量數(shù)據(jù)對生物樣本進(jìn)行系統(tǒng)研究,才能真正觀察到mRNA-蛋白質(zhì)關(guān)聯(lián)性,進(jìn)而從整體上解釋生物學(xué)問題。廈門上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)方法的不斷 發(fā)展和改進(jìn), 為單細(xì)胞層級的多組學(xué)整合分析奠定了 基礎(chǔ)。

從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細(xì)胞來源中檢測多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。單細(xì)胞測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。

高通量測序技術(shù)(High-throughputsequencing)又稱“下一代”測序技術(shù)(“Next-generation”sequencing),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定和一般讀長較短等為標(biāo)志。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,因此在有些文獻(xiàn)中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗,已助力Nature,immunity等在內(nèi)的300+篇CNS文章發(fā)表。單細(xì)胞多組學(xué) 測序技術(shù)會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測序分析和功能驗證同時 進(jìn)行的方法。

當(dāng)蜂巢孔內(nèi)同時落入細(xì)胞和磁珠后,接下去可以往BDCartridge板中加入細(xì)胞裂解液對細(xì)胞進(jìn)行裂解,使細(xì)胞內(nèi)的RNA與磁珠上的標(biāo)簽進(jìn)行結(jié)合,完成每個細(xì)胞內(nèi)RNA的捕獲和標(biāo)記。這時,再將捕獲了RNA的磁珠進(jìn)行回收,待所有質(zhì)控結(jié)果確認(rèn)通過后就可以進(jìn)行后續(xù)的RNA反轉(zhuǎn)錄、cDNA第二鏈合成等實驗操作。而BDCartridge板則需要再進(jìn)行一次成像,獲得磁珠收集后的掃描圖,判斷磁珠是否已經(jīng)被有效收集。根據(jù)每一步的質(zhì)控結(jié)果,烈冰科技(NovelBio)單細(xì)胞測序?qū)嶒瀳F(tuán)隊會根據(jù)單細(xì)胞分選的實驗結(jié)果生成實驗總結(jié)報告,判斷每一步驟是否通過質(zhì)控,并得到捕獲的單細(xì)胞數(shù)量以及雙細(xì)胞比例,對整個實驗進(jìn)行總結(jié)評估。若所有過程通過質(zhì)控,實驗樣本即可進(jìn)行下一步實驗操作。在單細(xì)胞水平上的多組學(xué)分析能夠為研究組提供前所未有的臨床和科研大數(shù)據(jù)。青島烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)多組學(xué)測序

單細(xì)胞測序技術(shù)遍地開花,烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。青島BD單細(xì)胞多組學(xué)平臺

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!此外,烈冰生信團(tuán)隊根據(jù)豐富的實戰(zhàn)經(jīng)驗為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化,還可以實現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰,專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您!青島BD單細(xì)胞多組學(xué)平臺

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