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全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)是將重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測序技術(shù)相結(jié)合,對有參考基因組進行全基因組范圍的單堿基分辨率的甲基化測序,是DNA甲基化檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)”。WGBS滿足全基因組DNA甲基化圖譜及疾病關(guān)聯(lián)分析、基因調(diào)控分析、疾病的甲基化標(biāo)志物篩選等探索性課題的研究。技術(shù)優(yōu)勢:DNA甲基化檢測**有力的工具,單堿基分辨率,檢測每個C堿基的甲基化狀態(tài),全基因組范圍,**限度地獲得甲基化信息,適合所有有參考基因組的物種適合各種類型的樣本。甲基化驗證是甲基化研究必不可少的一環(huán)。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗豐富
WGBS:科學(xué)方案設(shè)計:從項目背景了解、協(xié)助方案設(shè)計、實驗材料選取、建庫測序,到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學(xué)問題;需要專業(yè)、有價值的建議;科學(xué)、縝密的設(shè)計及時高效的溝通;以保障高質(zhì)量研究成果。樣本要求:基因組DNA:>=3ug;樣品濃度>30ng/ul;無RNA和蛋白污染建庫測序:測序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測序深度:>=30X。信息分析:基于全基因組范圍的甲基化分析,數(shù)據(jù)質(zhì)控,5mCCalling,5mC在基因組、染色體、功能元件上的分布,多樣本甲基化差異聚類,差異甲基化DMR鑒定及相關(guān)基因的功能分析,結(jié)合項目背景和科學(xué)問題的數(shù)據(jù)亮點挖掘。安徽WGBSDNA甲基化口碑推薦ATAC-seq實驗過程短,從實驗到分析可達2周。
DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸為甲基供體,將活性甲基轉(zhuǎn)移至DNA鏈中特定堿基上的化學(xué)修飾過程。哺乳動物基因組中,DNA甲基化多發(fā)生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一種表觀(epigenetic)修飾,它在不改變DNA序列的情況下,對個體的生長、發(fā)育、基因表達模式以及基因組的穩(wěn)定性起到重要的調(diào)控作用,這種修飾是可逆的,并且這種修飾在發(fā)育和細胞增殖的過程中是可以穩(wěn)定傳遞的。近年來的大量研究表明,DNA異常甲基化與**的發(fā)生、發(fā)展、細胞*變有著密切的聯(lián)系。
industryTemplateRRBS用于人、哺乳動物及魚類方向的高水平甲基化研究。
羥甲基化DNA免疫沉淀測序(HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,hMeDIP-Seq)是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DN**段,然后結(jié)合高通量測序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,快速、高效地尋找羥甲基化區(qū)域??蓮V泛應(yīng)用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過程中的研究。技術(shù)優(yōu)勢:從項目背景了解、協(xié)助方案設(shè)計、實驗材料選取、建庫測序,到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學(xué)問題;需要專業(yè)、有價值的建議;科學(xué)、縝密的設(shè)計及時高效的溝通;以保障高質(zhì)量研究成果強化版RRBS技術(shù)及應(yīng)用是高性價比方案。四川RRBSDNA甲基化口碑推薦
中小樣本篩選, 大樣本中進一步驗證。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗豐富
甲基化DNA免疫沉淀測序(MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,MeDIP-Seq)是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段,然后結(jié)合高通量測序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,快速、高效地尋找甲基化區(qū)域。可廣泛應(yīng)用于甲基化與疾病關(guān)系研究。樣本要求:基因組DNA:>=3ug;樣品濃度>50ng/ul;無RNA和蛋白污染,建庫測序:測序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測序深度:20-30Mreads。信息分析:基于全基因組范圍的羥甲基化分析,數(shù)據(jù)質(zhì)控,Peak鋒Calling,Peak鋒在基因組、染色體、功能元件上的分布,多樣本羥甲基化差異聚類,差異羥甲基化DMR鑒定及相關(guān)基因的功能分析,結(jié)合項目背景和科學(xué)問題的數(shù)據(jù)亮點挖掘。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗豐富