定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法學(xué)背景和意義：從生命活動(dòng)的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學(xué)的主要手段。而這些研究往往離不開對(duì)細(xì)胞、組織中含有蛋白質(zhì)種類和表達(dá)量的研究。對(duì)處不同時(shí)期、不同條件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化的研究，識(shí)別功能模塊和路徑，監(jiān)控疾病的生物標(biāo)志物，這些研究都需要對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定和定量。生物質(zhì)譜技術(shù)的出現(xiàn)和不斷成熟為蛋白質(zhì)差異表達(dá)分析提供了更可靠、動(dòng)態(tài)范圍更廣的研究手段?；谫|(zhì)譜技術(shù)，科學(xué)家們不斷開發(fā)出新的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法，來了解細(xì)胞、組織或生物體的整體蛋白質(zhì)動(dòng)力學(xué)。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等。南京定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

蛋白質(zhì)組學(xué)有什么用，能給我實(shí)驗(yàn)帶來什么？可以大規(guī)模鑒定特定組織、細(xì)胞等各種樣本的蛋白質(zhì)種類、修飾狀態(tài)以及蛋白質(zhì)之間的相互作用，以及對(duì)這些蛋白質(zhì)功能分析、分類；可以對(duì)不同條件下某一特定樣本進(jìn)行大規(guī)模的蛋白質(zhì)(包括翻譯后修飾蛋白)表達(dá)量變化分析，篩選潛在biomarker，篩選重要信號(hào)通路；依托大樣本量，可以實(shí)現(xiàn)疾病的分子分型分析、重要潛在靶標(biāo)鑒定。質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)和芯片哪個(gè)更好出結(jié)果？若有對(duì)應(yīng)物種的全基因組并有預(yù)測的全蛋白序列庫，可優(yōu)先選擇全蛋白序列庫；若無全蛋白序列庫，有對(duì)應(yīng)物種對(duì)應(yīng)組織的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果并，可以使用轉(zhuǎn)錄組的測序結(jié)果（mRNA三框翻譯或者預(yù)測CDS，并翻譯成氨基酸序列）；若基因組、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫都沒有，優(yōu)先選擇同源性比較接近的物種的全蛋白數(shù)據(jù)庫，若近源物種沒有合適的全蛋白庫，則選擇更大的蛋白全庫（如動(dòng)物全庫、綠色植物全庫、微生物庫等）。貴州蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)（從分析化學(xué)角度來看），就是對(duì)蛋白質(zhì)的定性定量分析。

蛋白組學(xué)常見研究模式主要有兩種：1.通過蛋白質(zhì)組學(xué)尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標(biāo)志物；2.結(jié)合其它組學(xué)建立疾病或者研究主題的表達(dá)譜和分子機(jī)制。蛋白質(zhì)組學(xué)( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)，包括組成蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的氨基酸序列，蛋白質(zhì)的豐度，蛋白質(zhì)的修飾以及蛋白質(zhì)之間的相互作用。蛋白質(zhì)組和基因組( genome)在概念上有相關(guān)性，表示某一個(gè)蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由基因組所編碼的，然而蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)在研究對(duì)象和研究方法上有很大的區(qū)別。

蛋白質(zhì)組學(xué)常用技術(shù)：非靶向蛋白組學(xué)：蛋白質(zhì)定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學(xué)。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)在研究對(duì)象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍。蛋白質(zhì)組學(xué)主要以全蛋白組（組織、細(xì)胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對(duì)象，通過對(duì)蛋白組進(jìn)行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學(xué)功能、作用機(jī)制、疾病診斷的標(biāo)志物以及預(yù)測蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水平預(yù)測的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。蛋白質(zhì)組可以隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)：產(chǎn)品分類：a.相對(duì)定量(目的同WB)。b.一定定量(目的同Elisa)。技術(shù)優(yōu)勢：（1）無需抗體，可直接對(duì)樣本中目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量分析。（2）高特異性、準(zhǔn)確度和靈敏度，靶向檢測目標(biāo)蛋白對(duì)應(yīng)的多個(gè)unique肽段。（3）通量高，可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)幾十個(gè)蛋白的定量檢測。樣本要求：動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本100mg/sample，血清、血漿200μL/sample，細(xì)胞、微生物1×107cells/sample。應(yīng)用方向：驗(yàn)證修飾和非修飾定量蛋白組學(xué)結(jié)果；目標(biāo)蛋白相對(duì)定量和一定定量分析。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究，針對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測與定量。蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的？南京定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

蛋白質(zhì)組學(xué)研究策略有什么？南京定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域

蛋白質(zhì)組學(xué)：蛋白質(zhì)組一詞，源于蛋白質(zhì)與基因組兩個(gè)詞的組合，意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”，即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征，包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生，細(xì)胞代謝等過程的整體而全方面的認(rèn)識(shí)。蛋白質(zhì)組的研究不只能為生命活動(dòng)規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ)，也能為眾多種疾病機(jī)理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過對(duì)正常個(gè)體及病理個(gè)體間的蛋白質(zhì)組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”，它們可成為新藥物設(shè)計(jì)的分子靶點(diǎn)，或者也會(huì)為疾病的早期診斷提供分子標(biāo)志。確實(shí)，那些世界范圍內(nèi)銷路*的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點(diǎn)為某種蛋白質(zhì)分子。因此，蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。南京定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域