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定量蛋白質(zhì)組學技術(shù):定量蛋白質(zhì)組學是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容,通過對基因表達產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來,隨著非凝膠技術(shù)的發(fā)展,蛋白質(zhì)組學(“Shotgun”proteomics)技術(shù),特別是多維蛋白質(zhì)鑒定(MultidimensionalProteinIdentification,MudPIT)已成為研究復雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質(zhì)表達和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質(zhì)組學在醫(yī)學的研究應用:蛋白質(zhì)組學是研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景。江蘇PRM定量蛋白質(zhì)組學檢測多少錢
蛋白質(zhì)組學概念:蛋白質(zhì)組學(英語:proteomics,又譯作蛋白質(zhì)體學),是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個詞的組合,意指“一種基因組所表達的全套蛋白質(zhì)”,即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,包括蛋白質(zhì)的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。上海醫(yī)學蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組具有很高的細胞和組織特異性,不同的細胞組織表達不同的蛋白質(zhì)組。
蛋白質(zhì)組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用?作為主要研究策略的蛋白質(zhì)組學:這與題目中的描述更相關(guān)些,蛋白質(zhì)組學是研究中的關(guān)鍵方法(甚至是唯1方法)。具體而言,蛋白質(zhì)組學在此類應用中,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學:事實上,在當前的生物醫(yī)學Q研究和臨床診斷中,蛋白質(zhì)組學相關(guān)技術(shù)有非常多的應用。因為蛋白質(zhì)組學技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學角度來看),就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。生物醫(yī)學和臨床診斷中,需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量、氨基酸序列、翻譯后修飾等信息。蛋白質(zhì)組學相關(guān)技術(shù)目前在一小部分應用中具有獨特優(yōu)勢。有很多蛋白質(zhì)組學的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進行相關(guān)研究和日常工作。
蛋白質(zhì)組學發(fā)展趨勢:技術(shù)發(fā)展方面:蛋白質(zhì)組學的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存,各有優(yōu)勢和的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外,更強調(diào)各種方法間的整合和互補,以適應不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外,蛋白質(zhì)組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術(shù)新方法的活水之源,特別是,蛋白質(zhì)組學與其它大規(guī)模科學如基因組學,生物信息學等領(lǐng)域的交叉,構(gòu)成組學(omics)生物技術(shù)研究方法,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(SystemBiology)研究模式,將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。蛋白質(zhì)組研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu)、細胞的功能、生命的本質(zhì)及活動規(guī)律。
蛋白質(zhì)組學研究策略有什么?“自頂向下”策略并不依賴于蛋白酶的酶切,而是直接鑒定完整蛋白質(zhì),在翻譯后修飾和蛋白質(zhì)同素異構(gòu)體鑒定方面有一些潛在的優(yōu)勢??墒窃摬呗缘娜毕菔堑鞍踪|(zhì)在氣相中分離、電離及碎裂都十分困難。而鳥管法蛋白質(zhì)組學由于將蛋白質(zhì)酶解成肽段,使其在氣相中更容易被分離、電離和碎裂;所以鳥管法蛋白質(zhì)組學在蛋白質(zhì)組學研究中得到了比較普遍的應用?!白灾邢蛳隆辈呗砸惨蕾囉诘鞍酌傅拿盖校怯捎诓捎昧肆硗獾拿?,比如OmpT,只能酶切(Lys/Arg-Lys/Arg),因此酶切之后的分子量較大,更利于后續(xù)的蛋白組裝環(huán)節(jié)。定量蛋白質(zhì)組學是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容。浙江修飾蛋白組學方法
蛋白質(zhì)組學是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。江蘇PRM定量蛋白質(zhì)組學檢測多少錢
非標定量法(Label-free)是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度,分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化,認為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關(guān),因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度,通過適當?shù)臄?shù)學公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進行定量。按照其原理主要分為兩種,第1種spectrumcounts類的非標記方法,發(fā)展比較早,已經(jīng)形成多種定量算法,但是主要的原理都是以MS2的鑒定結(jié)果為定量基礎(chǔ),各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。第二種非標記定量的原理是以MS1為基礎(chǔ),計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。江蘇PRM定量蛋白質(zhì)組學檢測多少錢