代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產物發(fā)生相應的改變,通過對某些代謝產物進行分析,并與正常人的代謝產物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。代謝組學作為系統生物學的重要組成部分,在臨床醫(yī)學領域具有普遍的應用前景。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學鑒定
非靶向代謝組學:非靶向代謝組學可用于檢測生物體內大多數小分子代謝物的動態(tài)變化,通過數據處理,多維統計和數學建模來分析生物擾動下的代謝指紋圖譜。尋找兩組間發(fā)生明顯變化的差異代謝物,富集差異代謝通路, 獲得整個生物體的代謝輪廓。 技術優(yōu)勢: 1、代謝組學能放大基因組和蛋白組的微小變化,具有較高的靈敏度、分辨率; 2、具有較寬的動態(tài)檢測范圍;3、相比于基因組學和蛋白質組學,檢測費用更為低廉;4、代謝組學比較貼近生物體表型,能更直接、準確地反映生物體的生理病理狀態(tài),適合于生物樣本中潛在標志物的篩選,疾病分期等。湖北常規(guī)靶向代謝組學領域代謝組學主要研究的是產物的小分子代謝物(MW<1000)。
代謝組學的研究領域有哪些?1、疾病機制研究;2、疾病診斷與防治;3、新藥篩選和開發(fā);4、藥物作用機制的研究;5、藥物毒性評價;6、植物的細胞代謝組學研究;7、微生物代謝組學研究。代謝組學的研究方法:代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析,采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜峰,了解不同化合物的結構,建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析,研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進行更深入的研究。
代謝組學適用范圍:1、體液:血清、血漿、尿液、唾液、膝蓋滑液、腦脊液、卵泡液、牛奶、痰液、舌苔液、膽汁等。2、組織:各種動物組織和植物組織。3、細胞:細胞及細胞培養(yǎng)液等。3、微生物:大腸桿菌、鏈球菌等。4、其他:糞便、食糜、腸道內容物等。應用領域:1、非靶向代謝物組學結果的驗證。2、代謝相關生理、病理研究。3、發(fā)酵工藝研究。4、食品科學與營養(yǎng)學研究。非靶向代謝組學分析內容:非靶向代謝組學分析內容大致包括數據的預處理(包括質譜峰提取和質譜峰校正)-數據質控(包括t-檢驗、主成分分析等)--差異代謝物分析(包括聚類分析、通路注釋分析、多組學關聯分析等)。代謝組學是繼基因組學、蛋白質組學、轉錄組學后出現的新興“組學”。
代謝組學檢測的手段有哪些?主要技術手段是核磁共振(NMR ),液-質聯用(LC-MS),氣-質聯用(GC-MS),色譜(HPLC,GC)等。通過檢測一系列樣品的譜圖,再結合化學模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),基因的功能,藥物的毒性和藥效等,并有可能找出與之相關的生物標志物(biomarker)。代謝組學可以檢測哪些樣品?代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(MW<1000)。其樣品主要是尿液,血漿或血清,唾液,以及細胞和組織的提取液。我們也做過植物,微生物提取物,腦脊液昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,糞便及腸道內容物提取液等。代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些?廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學鑒定
代謝組學是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學鑒定
GC-MS非靶向與代謝組學的關系?代謝組學是運用多種技術手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質等)的種類、數量及變化規(guī)律的科學,是系統生物學的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學是對生物體內源性代謝物進行系統全方面的分析平臺。氣相色譜-質譜聯用(GC-MS)技術因為其較為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現性好,擁有大量標準質譜圖數據庫的特點,被大量地運用在植物、動物、微生物的研究中。隨著信息科學和分析技術的發(fā)展,運用GC-MS非靶向代謝組學研究疾病機制和發(fā)現藥物靶點的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學也在代謝性疾病等藥物靶點、疾病機制研究和藥物靶點發(fā)現中提供重要參考和啟示。廣州LC-MS/MS非靶向代謝組學鑒定