質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾：相對于蛋白質(zhì)印跡等技術，質(zhì)譜技術能更有效的對蛋白質(zhì)的翻譯后修飾進行分析，且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進行補充。質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質(zhì)譜方法無法保證可以完全識別目的蛋白的特定翻譯后修飾，因為質(zhì)譜是通過蛋白質(zhì)序列內(nèi)的多個肽段來鑒定的，這很大程度上降低了翻譯后修飾肽段被識別的機會。一種提高質(zhì)譜儀檢測到修飾肽段數(shù)量的策略是使用PTM親和試劑進行肽段富集，而不是使用PTM親和試劑進行蛋白富集，這將減少富集的未修飾肽段的數(shù)量。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學具有探索性。山東蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學有哪些
蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型：根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同，可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類，即O-磷酸鹽蛋白質(zhì)、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、酰基磷酸鹽蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì)。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過羥氨基酸（如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸）的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。3、 ?；姿猁}蛋白質(zhì)通過天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過半胱氨酸磷酸化形成。蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法：免疫印跡技術是在凝膠電泳和固相免疫測定技術基礎上發(fā)展起來的、根據(jù)特定抗原-抗體的特異性反應來檢測復雜樣品中的某種蛋白質(zhì)的免疫生化分析方法。江蘇蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學有哪些蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾時其分子質(zhì)量會發(fā)生響應的改變，通過質(zhì)譜能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽的分子質(zhì)量。
蛋白磷酸化檢測方法：一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢：1. WB方法簡便，多數(shù)實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏，能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白，可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集，再進行WB檢測被磷酸化的蛋白，檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法：Western Blot的方法雖然簡便，但是對于大規(guī)模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質(zhì)譜儀，如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠，或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白，將含有目標蛋白的條帶切下，胰酶消化，LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法：質(zhì)譜鑒定法：在質(zhì)譜分析中，先使試樣中各組分電離生成不同荷質(zhì)比的離子，然后經(jīng)加速電場的作用，生成離子束，進入質(zhì)量分析器。在質(zhì)量分析器中，在磁場的作用下，質(zhì)荷比相同的離子會被聚焦到同一點上，不同質(zhì)荷比的離子聚焦于不同點上，因此獲得區(qū)分不同質(zhì)荷比離子的質(zhì)譜圖。與未經(jīng)修飾的肽段相比，磷酸基團修飾的肽段在相對分子質(zhì)量上就會增加79.983，由此在質(zhì)譜圖中能夠與未修飾肽段進行區(qū)分。固相金屬離子親和色譜利用的是磷酸基團與固相化的金屬離子有高親和力,可有效吸附磷酸化基團，從而達到富集磷酸化肽段的效果。鰲合底物上的金屬離子通常是Fe3+或Ga3+，可以選擇性地與磷酸化肽中的磷酸部分相結(jié)合,并且在高pH或磷酸緩沖液中磷酸化肽可以釋放出來。但是這個方法不能夠有效富集不與IMAC結(jié)合的磷酸化肽段。蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術優(yōu)點：能夠特異鑒定單個磷酸化位點。
蛋白質(zhì)乙?；揎楄b定流程：1. 組織/細胞破碎，提取、提純目的蛋白質(zhì)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙?；贵w對乙酰化修飾肽段進行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙酰化肽段進行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析，并對鑒定的乙?；稽c的生物學功能進行解釋預測。隨著蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展，我們越來越深刻地意識到，對于生物體生命活動的管理和調(diào)控過程，密切相關的不只是單個蛋白質(zhì)層面的修飾狀態(tài)，更重要的是研究蛋白質(zhì)組學水平研究在翻譯后修飾的動態(tài)變化。高質(zhì)、高效的蛋白質(zhì)翻譯后修飾富集技術和豐富的、準確的定量手段使得研究蛋白質(zhì)水平的翻譯后修飾組學成為現(xiàn)實，借助這些組學研究手段能夠?qū)崿F(xiàn)不同生理病理狀態(tài)下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較，深入地揭示翻譯后修飾水平的波動與生物生命活動的密切聯(lián)系。蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進行共價加工的過程。浙江氧化修飾蛋白質(zhì)組學方法
質(zhì)譜可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。山東蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學有哪些
蛋白質(zhì)修飾位點分析：基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性，從而檢測蛋白質(zhì)或者多肽上位點發(fā)生何種修飾。可檢測修飾類型如下： 磷酸化、糖基化、乙?；⒎核鼗⒈；?、丁?；?、丙二?；⑽於；㈢牾；?、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化：信號轉(zhuǎn)導、細胞周期、生長發(fā)育機理等；2、糖基化：蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應答等；3、乙?；夯虮磉_調(diào)控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性的病變等；4、泛素化：細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復以及信號轉(zhuǎn)導等；5、甲基化：染色質(zhì)結(jié)構及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等；6、丙酰化 / 丙二?；?/ 戊二酰化 / 琥珀?；褐饕嬖谟诰€粒體和細菌中，與代謝過程密切相關。山東蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學有哪些
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