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為同時獲得空間表達和組織學(xué)背景信息，該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學(xué)染色和成像，然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問題，針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案無法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly（dA）序列進行mRNA捕獲。該方案采用針對編碼基因的成對RNA模板連接探針（RTL）與mRNA雜交。左側(cè)探針（LHS）具有部分Read 2序列，右側(cè)探針（RHS）具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接，而mRNA被RNase降解。組織透化后，被連接的成...

空間轉(zhuǎn)錄組測序在病理學(xué)中，通過添加基因表達維度，得出形態(tài)學(xué)結(jié)論，通過觀察基因表達區(qū)域，了解可能發(fā)生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學(xué)，研究免疫細胞浸潤、不同區(qū)域的免疫細胞中的基因表達特征；免疫群體擴散、不同類型免疫細胞的空間位置解析； 在神經(jīng)科學(xué)，研究大腦皮層層狀組織解析，揭示大腦皮層的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系，正常vs.疾病大腦結(jié)構(gòu)特征分析與疾病相關(guān)的基因表達于特定的大腦皮層； 在發(fā)育生物學(xué)，通過解析每個發(fā)育階段不同解剖區(qū)域特有的基因表達特征，解析組織中與形態(tài)形成相關(guān)基因；豐富基因表達的空間注釋信息，創(chuàng)建組織發(fā)育的空間細胞圖譜。自主研發(fā)PanoCell單細胞實驗測序平臺。武漢上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服...

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應(yīng)的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。烈冰引進國際主流空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺，提供保留組織內(nèi)部精細區(qū)...

在發(fā)育過程或疾病發(fā)生過程中，組織內(nèi)部的不同細胞經(jīng)歷了復(fù)雜的生物學(xué)過程，因此，組織內(nèi)部的異質(zhì)性研究是目前揭示重要生物學(xué)研究的一個重要研究手段。組織內(nèi)部的異質(zhì)性包括細胞類型的異質(zhì)性和空間位置的異質(zhì)性兩個層面，細胞類型異質(zhì)性可由單細胞測序來完美呈現(xiàn)，而空間位置的異質(zhì)性，則需要可高通量地檢測全轉(zhuǎn)錄組空間信息的新型研究方法來解決。烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控，做到從實驗設(shè)計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務(wù)，助力高分文章發(fā)表。全線搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺。成都BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持所謂的高通量測序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測序，是將DNA...

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學(xué)價值。每一個部分都不可或缺，其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。國產(chǎn)化Pa...

空間組測序技術(shù)，作為現(xiàn)階段單細胞技術(shù)的重要補充技術(shù)進入了組學(xué)的實驗領(lǐng)域以及生物信息學(xué)的分析領(lǐng)域。通過單細胞測序（單細胞表達尺度）+空間轉(zhuǎn)錄組測序（空間表達尺度）+數(shù)字病理（臨床診斷尺度）聯(lián)合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng)，多角度深入分析組織的形態(tài)特征、基因組學(xué)特征、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境。不同于單細胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式，空間轉(zhuǎn)錄組分析實際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動的，尤其是對于組織切片的理解，一個在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán)，也是重中之重。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務(wù)。杭州烈冰空間轉(zhuǎn)錄...

基于橋式PCR技術(shù)的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍，保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP：1）堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團，用于區(qū)分ATCG；2）3端使用疊氮基團封閉，保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時，會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像，再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團，開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點的熒光，實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學(xué)反應(yīng)并不可控，隨著循環(huán)數(shù)的增大會出現(xiàn)不同步的情況，因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。烈冰測序服務(wù)已助力300余篇國際主流期刊研究文章發(fā)表。溫州空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析解決空間轉(zhuǎn)錄組測序...

為同時獲得空間表達和組織學(xué)背景信息，該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學(xué)染色和成像，然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問題，針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案無法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly（dA）序列進行mRNA捕獲。該方案采用針對編碼基因的成對RNA模板連接探針（RTL）與mRNA雜交。左側(cè)探針（LHS）具有部分Read 2序列，右側(cè)探針（RHS）具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接，而mRNA被RNase降解。組織透化后，被連接的成...

10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcodedspots），每個點的直徑為55μm，點和點之間中心的距離為100μm，并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應(yīng)的barcode序列，然后進行文庫構(gòu)建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置，從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。杭州上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持空間組測序技術(shù)...

空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)（Spatial Transcriptomics）是指在組織切片上完成，保留樣本空間信息的組學(xué)研究?？臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況，揭示精細病理區(qū)域中激發(fā)的信號通路，完成分子特征驅(qū)動病理特征的機制解析?？臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的技術(shù)革新，對于診斷標志物、耐藥位點以及靶向藥物的研發(fā)，免疫治等新興領(lǐng)域都具有重要作用。當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時，通過透化處理，細胞內(nèi)的mRNA釋放出來，從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄，得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列...

單細胞測序技術(shù)是一種在單細胞水平上對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術(shù)。單細胞測序技術(shù)能夠在組學(xué)水平揭示細胞間的異質(zhì)性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評選的科學(xué)突破。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息，而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息?？臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器。測序的革新讓科學(xué)研究從個體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個體細胞的基因差異。北京烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序價格烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、...

RNA測序（RNA-seq）是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具，也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性，轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢：1）能夠動態(tài)考察細胞基因組的表達，多維度地反映差異變化；2）可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA，研究其結(jié)構(gòu)以及在細胞生命活動中的重要調(diào)控作用；3）與蛋白組學(xué)研究相互補充，多角度呈現(xiàn)細胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ)，RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代，現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序基因測序是基...

單細胞測序技術(shù)是一種在單細胞水平上對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術(shù)。單細胞測序技術(shù)能夠在組學(xué)水平揭示細胞間的異質(zhì)性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評選的科學(xué)突破。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息，而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息?？臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理，完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。武漢BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組平臺相比于常規(guī)...

在轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域，空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)評價為2020年度方法，空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎，它將帶領(lǐng)組學(xué)在生物學(xué)的研究上進入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實現(xiàn)單細胞轉(zhuǎn)錄測序，這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助?，F(xiàn)在，新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息，同時還提供空間信息，幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置，進一步擴展到單細胞分辨率，這會更大程度提升科學(xué)家對單個細胞的認識和解讀。烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。濟南上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程：1、組織優(yōu)化由于不同物種、組織來源的樣本所...

高通量測序技術(shù)（High-throughputsequencing）又稱“下一代”測序技術(shù)（“Next-generation”sequencing），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing)足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。而烈冰科技具有專業(yè)生物背景和十二年科研服務(wù)經(jīng)驗，已...

空間轉(zhuǎn)錄組研究的的必耍性：研究單細胞是想要探究細胞間的異質(zhì)性，但是常規(guī)的單細胞是將細胞解離成單細胞懸液，然后利用單細胞分離技術(shù)（微孔，微板，液滴）等方法實現(xiàn)單細胞建庫，這里比較大的問題是是細胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個空間信息在實際研究中是非常重要。特別是在研究細胞命運機制及細胞譜系發(fā)生空間位置的信息顯得尤為重要，因此發(fā)展空問轉(zhuǎn)錄組技術(shù)實現(xiàn)細胞的位置信息的保留，對研究此類細胞狀態(tài)尤為必要?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣，為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。廣州BD空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點陣的分群與定...

所謂的高通量測序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測序，是將DNA（或者cDNA）隨機片段化、加接頭，制備測序文庫，通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進行延伸反應(yīng)，檢測對應(yīng)的信號并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法相比，高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有強大的優(yōu)勢，又快（兩天）又多（數(shù)百萬克?。蔀槟壳敖M學(xué)研究的主要技術(shù)。空間轉(zhuǎn)錄組測序是一個系統(tǒng)的工程，開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配，如果匹配，實驗過程如何規(guī)劃，實驗平臺如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了，從銷售到實驗到專業(yè)技術(shù)支持，我們開通全線對接渠道，幫助您快速定位項目訴...

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程：1、組織優(yōu)化由于不同物種、組織來源的樣本所需的比較好透化時間不盡相同，在正式開展空間轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒炃埃枰媒M織優(yōu)化kit進行條件的摸索。組織優(yōu)化芯片上包含8個捕獲區(qū)域，每個區(qū)域均覆蓋了熒光標記探針，可捕獲mRNA形成帶有熒光標簽的cDNA，隨即可通過熒光成像結(jié)果判定比較好透化時間及組織優(yōu)化條件。2、空間轉(zhuǎn)錄組測序確定組織優(yōu)化條件后，即可進行切片、H&E染色及成像、空間轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建及測序分析流程。截至2021年10月，烈冰助力發(fā)表空間轉(zhuǎn)錄組測序文章近20篇。溫州烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化其實，空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了，目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide...

轉(zhuǎn)錄組分析指對細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析。轉(zhuǎn)錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶（oligo-dT）進行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺，轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計探針，即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測，提供更精確的數(shù)字化信號，是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強大工具。FFPE空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理 為同時獲得空間表達和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次翻天覆地的改變，一次對幾十萬到幾百...

10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcodedspots），每個點的直徑為55μm，點和點之間中心的距離為100μm，并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應(yīng)的barcode序列，然后進行文庫構(gòu)建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置，從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。全線搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺。廈門scRNA空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細胞...

空間轉(zhuǎn)錄組研究的的必耍性：研究單細胞是想要探究細胞間的異質(zhì)性，但是常規(guī)的單細胞是將細胞解離成單細胞懸液，然后利用單細胞分離技術(shù)（微孔，微板，液滴）等方法實現(xiàn)單細胞建庫，這里比較大的問題是是細胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個空間信息在實際研究中是非常重要。特別是在研究細胞命運機制及細胞譜系發(fā)生空間位置的信息顯得尤為重要，因此發(fā)展空問轉(zhuǎn)錄組技術(shù)實現(xiàn)細胞的位置信息的保留，對研究此類細胞狀態(tài)尤為必要?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務(wù)讓您的生物醫(yī)學(xué)研究如虎添翼。烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組服務(wù)機構(gòu)轉(zhuǎn)錄組分析指對細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析。轉(zhuǎn)錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶（oligo-dT）進行親和純化的R...

空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學(xué)價值。每一個部分都不可或缺，其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。烈冰全線實...

空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細胞測序的結(jié)果不同，這里存在一個概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候，貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上，那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子，但是沒有基因表達，即無有效Spot位點。同樣的，另一個就是組織切片的大小，也就是說組織切片在整個玻片的覆蓋面積越小，分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎(chǔ)質(zhì)量。十二年測序經(jīng)驗，累計服務(wù)與5000余項重要科研項目。溫州BD空間...

烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作，服務(wù)于600+臨床與研究機構(gòu)，1000+客戶和5000+重要科研項目，助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊（不完全統(tǒng)計），在單細胞領(lǐng)域，烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇，總IF＞300+，IF＞10+以上文章占比65%以上，包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊，已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機制，免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)提供了空間轉(zhuǎn)錄組...

機體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時，往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被“沉默”，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構(gòu)建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。烈冰全線實...

空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以用單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析策略進行分析，例如，利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時期特定空間區(qū)域內(nèi)的信號通路及其關(guān)鍵基因的較大情況，揭示在特定發(fā)育時期特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生的生物學(xué)過程。針對任何一個基因，空間轉(zhuǎn)錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間排布；單細胞轉(zhuǎn)錄組可以給出該基因表達的細胞類群；原位測序可以給出該基因在細胞內(nèi)的表達狀況。通過不同發(fā)育時間點的信息比較，可以分析細胞類群在某個部位在不同時間點的差異，給出其在細胞內(nèi)的真實的演變狀況。助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息；助力生命健康醫(yī)療大時代！廣州高通量測序空間轉(zhuǎn)錄組測序價格空間組學(xué)可以應(yīng)用的方向：1.可以鑒定到疾...

烈冰生物真正實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測序的全程把控，做到從實驗設(shè)計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務(wù)，助力高分文章發(fā)表；專業(yè)實驗團隊保證樣本的高度一致性；專業(yè)的生物學(xué)團隊提供個性化的產(chǎn)品應(yīng)用場景解讀、保持對生物學(xué)意義的關(guān)注；強大的生信分析團隊一對一地進行詳實科學(xué)的實驗方案設(shè)計并提供多次售后分析；可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經(jīng)液氮預(yù)冷的異戊烷速凍，-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進行OCT包埋，或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標明樣本方向，樣本于-80℃保存樣本處理和運輸過程需要在低溫環(huán)境強勢發(fā)文！烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序助力揭示愈傷組織能再生的機制。南京B...

10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcodedspots），每個點的直徑為55μm，點和點之間中心的距離為100μm，并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應(yīng)的barcode序列，然后進行文庫構(gòu)建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置，從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。西安烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組平臺高通量測序技術(shù)（High-t...

生命科學(xué)研究的目的之一就是為了解決細胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測序技術(shù)可提供特定條件下某些 組織中基因的表達信息，不僅可以推斷出相應(yīng)未知基因的功能，揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機制，而且可以辨別細胞的類型和異質(zhì)性，為疾病診斷提供理論依據(jù)。但由于研究的深入或具體研究方向和內(nèi)容的不同，傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)顯然不能夠滿足科研工作者們強烈的好奇心，更加直觀地反映組織中基因的表達情況，隨即單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single-cell RNA-sequencing，scRNA-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（Spatial transcriptomics，ST）測序等一系列技術(shù)應(yīng)運而生。烈冰實驗室包含從樣本處理...

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