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生命科學研究的目的之一就是為了解決細胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測序技術可提供特定條件下某些 組織中基因的表達信息，不僅可以推斷出相應未知基因的功能，揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機制，而且可以辨別細胞的類型和異質(zhì)性，為疾病診斷提供理論依據(jù)。但由于研究的深入或具體研究方向和內(nèi)容的不同，傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組測序技術顯然不能夠滿足科研工作者們強烈的好奇心，更加直觀地反映組織中基因的表達情況，隨即單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single-cell RNA-sequencing，scRNA-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（Spatial transcriptomics，ST）測序等一系列技術應運而生?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序可識別重要...

烈冰科技作為國內(nèi)同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商，經(jīng)過多年實戰(zhàn)，擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經(jīng)驗，實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法，實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預處理工作流程；烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學研究、醫(yī)療健康等領域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測序?qū)嶒炂脚_，包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來自海內(nèi)外名校、多學科交叉型的高素質(zhì)綜合團隊，為您的科學研究保駕護航。...

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序技術通過將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學背景整合，使基因表達譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉(zhuǎn)錄組測序技術局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案，該技術打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉(zhuǎn)錄組基因表達信息的壁壘，能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關基因的表達信息，在形態(tài)學背景下實現(xiàn)真正的探索發(fā)現(xiàn)，進一步擴展空間生物學的可能性。經(jīng)驗豐富的實驗團隊，為獲得示組織內(nèi)真實表達水平的高質(zhì)量冷凍切片提供硬件和技術保障。北京BD空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服...

生命科學研究的目的之一就是為了解決細胞和組織以及該組織如何影響功能這一難題。測序技術可提供特定條件下某些 組織中基因的表達信息，不僅可以推斷出相應未知基因的功能，揭示特定調(diào)節(jié)基因的作用機制，而且可以辨別細胞的類型和異質(zhì)性，為疾病診斷提供理論依據(jù)。但由于研究的深入或具體研究方向和內(nèi)容的不同，傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組測序技術顯然不能夠滿足科研工作者們強烈的好奇心，更加直觀地反映組織中基因的表達情況，隨即單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single-cell RNA-sequencing，scRNA-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（Spatial transcriptomics，ST）測序等一系列技術應運而生。烈冰專精空間轉(zhuǎn)錄組測序領...

基于橋式PCR技術的簇生成可以將模版鏈迅速擴增成千上萬倍，保證過程中足夠的測序深度。測序時使用特殊標記的dNTP：1）堿基上通過敏感鍵修飾上不同的熒光基團，用于區(qū)分ATCG；2）3端使用疊氮基團封閉，保證一次循環(huán)只上一個dNTP。每一輪循環(huán)結(jié)束時，會通過高速熒光顯微鏡記錄熒光圖像，再通入試劑除去熒光基團和疊氮基團，開啟下一循環(huán)。通過分析讀取同一位點的熒光，實時獲取模版鏈的堿基序列。由于過程中使用的化學反應并不可控，隨著循環(huán)數(shù)的增大會出現(xiàn)不同步的情況，因此Illumina的讀長只能限制在200bp左右。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復雜疾病研究的測序。南京空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化細胞中...

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎用戶也可以運用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況?？臻g轉(zhuǎn)錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況，揭示精細...

在轉(zhuǎn)錄組學領域，空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學評價為2020年度方法，空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎，它將帶領組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實現(xiàn)單細胞轉(zhuǎn)錄測序，這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助?，F(xiàn)在，新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息，同時還提供空間信息，幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置，進一步擴展到單細胞分辨率，這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀。國產(chǎn)化PanoCell空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺，提供高性價比服務方案。武漢烈冰空間轉(zhuǎn)錄組測序價格高通量測序技術（High-throughputsequencing...

烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉(zhuǎn)分析工具，構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程；精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器，可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細胞測序分析結(jié)果，詳細深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata（原始數(shù)據(jù)）到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后，就進入了空轉(zhuǎn)的第二步，去進行Spot的Cluster的過程，熟悉單細胞測序的研究者知道，Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype（當然分情況也會有不同）。而在空轉(zhuǎn)中，也正是由于前面提到了細胞的非單一性，導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型...

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析，可精確地描述每一個細胞的狀態(tài)，在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而，單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息，對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序，可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入，無疑讓單細胞測序如虎添翼，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關系，一度成為高通量測序技術的“天花板”。廈門scRNA空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”...

烈冰提供空間轉(zhuǎn)錄組全流程服務，包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續(xù)的FISH驗證等各個步驟，為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數(shù)字掃描儀為基礎的先進實驗平臺，并制定嚴格規(guī)范的實驗室SOP，經(jīng)過大量的切片、貼片實操演練，對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優(yōu)化，確保獲得更好質(zhì)量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺，搭建0代碼需求的空間轉(zhuǎn)錄組分析流程，準確快速解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。取同一樣本組織的相鄰區(qū)域進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序，通過單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的整合分析，...

在轉(zhuǎn)錄組學領域，空間轉(zhuǎn)錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉(zhuǎn)錄組學評價為2020年度方法，空間轉(zhuǎn)錄組方法近幾年越來越受到歡迎，它將帶領組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉(zhuǎn)錄組測序到實現(xiàn)單細胞轉(zhuǎn)錄測序，這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助。現(xiàn)在，新的空間轉(zhuǎn)錄組方法不僅帶來轉(zhuǎn)錄組信息，同時還提供空間信息，幫研究者更好辨別轉(zhuǎn)錄的位置，進一步擴展到單細胞分辨率，這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，烈冰配套全程個性化、定制化地數(shù)據(jù)分析服務。深圳BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組測序服務10XVisium的實驗主要分為兩部分：組織...

空間轉(zhuǎn)錄組測序的關鍵就在于，解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區(qū)域內(nèi)的冰凍組織切片在經(jīng)過H&E染色和成像記錄后，會被進行透化處理，釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設置了帶有獨特標識的條形碼區(qū)域。芯片被劃分為了數(shù)個不同的捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列。每個區(qū)域?qū)慕M織位置會被記錄下來，然后再進行測序后，通過條形碼將不同區(qū)域的測序結(jié)果，映射到對應的組織位置上，拼貼形成組織樣品的空間轉(zhuǎn)錄組圖像?？臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學研究視角。濟南BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術支持RNA測序（RNA-seq）是轉(zhuǎn)錄組學研究的重要工具，也是生命科學...