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廣州蛋白質甲基化修飾組學有哪些類型

來源: 發(fā)布時間:2022-04-09

蛋白質翻譯后修飾:蛋白質的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的氨基酸結合,調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。各種蛋白質翻譯后修飾在信號通路和網絡中發(fā)揮著重要的作用,翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒定蛋白質翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間,并且酶反應的優(yōu)化常常難以實現(xiàn)。而計算的方法則能夠快速、準確的預測酶特異性的底物蛋白質及其修飾位點。蛋白質修飾位點能夠影響蛋白的多種屬性,包括蛋白質折疊、活性以及之后的功能。廣州蛋白質甲基化修飾組學有哪些類型

乙?;揎椀鞍捉M學應用方向:1、乙?;揎椗c細胞基因表達調控、表觀調控、細胞凋亡、細胞代謝、信號轉導、蛋白質穩(wěn)定性等生理過程研究。2、乙?;鸬拇x疾病、代謝紊亂發(fā)生等疾病機理研究。乙?;飳W意義:1、調節(jié)DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、與其他PTMs發(fā)生crosstalk;3、調節(jié)酶活性;4、調控蛋白亞細胞定位。生物領域各個研究方面,如:1、農林領域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護研究等;2、 畜牧業(yè):肉類及乳品質研究,致病機理研究等。山東琥珀?;揎椀鞍踪|組學質譜鑒定蛋白質磷酸化修飾的免疫印跡技術優(yōu)點:能夠特異鑒定單個磷酸化位點。

根據(jù)不同的作用位點,蛋白質乙?;揎椃譃椋喊l(fā)生在蛋白N端的乙?;揎?、發(fā)生在蛋白賴氨酸上的乙?;揎棥G罢甙l(fā)生在90%以上的真核生物新生蛋白上,對于新生蛋白的成熟和細胞定位非常重要,由N乙酰轉移酶(NATs)負責;而后者是一個可逆的過程,主要由賴氨酸乙?;福↘ATs)和賴氨酸去乙?;福↘DACs),賴氨酸的乙?;揎検俏覀兡壳把芯康闹攸c。蛋白質磷酸化修飾應用領域:應用在食品工業(yè)方面,通過人工翻譯磷酸化修飾的蛋白可以普遍用于各種食用蛋白質的改性,以改善蛋白質品質。如,花生蛋白、大豆蛋白、小麥面筋蛋白等。在人工磷酸化修飾的方法下,也可以研究各種蛋白質的功能和相關代謝途徑的調控。在醫(yī)學領域,蛋白質的磷酸化紊亂,會導致細胞周期調控異常,因此,病理的形成與蛋白質的磷酸化異常也有很大相關性。其分子機制問題對于病癥等重大疾病的研究具有相當?shù)闹笇б饬x,這也是指當之無愧地成為生物學研究領域中的熱點。

蛋白質乙?;揎楄b定流程:1. 組織/細胞破碎,提取、提純目的蛋白質。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙?;贵w對乙酰化修飾肽段進行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙?;亩芜M行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析,并對鑒定的乙?;稽c的生物學功能進行解釋預測。隨著蛋白質組研究的發(fā)展,我們越來越深刻地意識到,對于生物體生命活動的管理和調控過程,密切相關的不只是單個蛋白質層面的修飾狀態(tài),更重要的是研究蛋白質組學水平研究在翻譯后修飾的動態(tài)變化。高質、高效的蛋白質翻譯后修飾富集技術和豐富的、準確的定量手段使得研究蛋白質水平的翻譯后修飾組學成為現(xiàn)實,借助這些組學研究手段能夠實現(xiàn)不同生理病理狀態(tài)下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較,深入地揭示翻譯后修飾水平的波動與生物生命活動的密切聯(lián)系。蛋白質的磷酸化修飾是生物體內重要的共價修飾方式之一。

蛋白磷酸化檢測方法:質譜檢測方法優(yōu)勢:1. 準確度高,能夠同時檢測多個蛋白的多個磷酸化位點。2. 適用于大規(guī)模分析蛋白磷酸化水平。3. 不依賴于磷酸化抗體。在實際應用中,Western Blot與質譜分析方法各有各的好,誰也無法完全被另一種方法所替代。所以在選擇測定磷酸化修飾的時候還應該根據(jù)具體需要來決定。如果研究的蛋白正好有商業(yè)化的磷酸化抗體,那么lucky you,你可以選擇Western Blot進行快速磷酸化測定研究。但是如果你所研究的蛋白質沒有可用的商業(yè)化磷酸抗體,或是抗體價效過低,亦或是需要大規(guī)模地檢測細胞內磷酸化蛋白的水平的話,質譜檢測會是更好地選擇。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的定位。貴陽丙酰化修飾蛋白質組學分析

常見的蛋白質翻譯后修飾包括乙?;?。廣州蛋白質甲基化修飾組學有哪些類型

翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質翻譯后修飾是影響蛋白質功能并調節(jié)整個細胞過程的重要方式,幾乎在每個細胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質對揭示蛋白質的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。因此,要在蛋白質組學的范圍內表征翻譯后修飾蛋白,純化方法是必要的,以分離修飾蛋白和肽段,然后再進行后續(xù)分析。后續(xù)分析一般采用質譜技術進行,可以對翻譯后修飾蛋白組進行定性和定量研究。廣州蛋白質甲基化修飾組學有哪些類型