轉(zhuǎn)錄組是干什么用的,和表達(dá)譜有什么區(qū)別?轉(zhuǎn)錄組,指細(xì)胞某一時(shí)期所有基因的轉(zhuǎn)錄水平。轉(zhuǎn)錄組學(xué),是一門(mén)在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。簡(jiǎn)而言之,轉(zhuǎn)錄組學(xué)是從RNA水平研究基因表達(dá)的情況。對(duì)RNA的分析。分析應(yīng)該是分幾個(gè)維度的DNA到RNA,RNA的剪切拼接,RNA的翻譯。表達(dá)譜有兩種,分別是基因表達(dá)譜和蛋白質(zhì)表達(dá)譜。基因表達(dá)譜是指細(xì)胞中所有基因表達(dá)的格局。通過(guò)比較分析基因表達(dá)譜,可從整體水平研究代謝機(jī)制,認(rèn)識(shí)基因相互作用的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,發(fā)現(xiàn)重要基因。轉(zhuǎn)錄組學(xué)能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。浙江IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析方法
全轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序技術(shù)優(yōu)勢(shì):文庫(kù)優(yōu)化:針對(duì)不同長(zhǎng)度的序列采用兩種文庫(kù)構(gòu)建方法,采用去核糖體的鏈特異性文庫(kù)可以獲得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。數(shù)據(jù)全:全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序完成后可獲取4類主要RNA(miRNA,mRNA,lncRNA,circRNA)數(shù)據(jù),可對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)分析及整合分析。關(guān)聯(lián)全:通過(guò)對(duì)mRNA/miRNA/lncRNA/circRN序列測(cè)定及后續(xù)分析,深入開(kāi)展全轉(zhuǎn)錄組調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(ceRNA網(wǎng)絡(luò))分析。樣本類型:細(xì)胞,組織,體液、血清、血漿、全血,總RNA等。建議總RNA起始量:>15μg,濃度≥200ng/μL)。廣東外泌體microRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)主要技術(shù)轉(zhuǎn)錄組學(xué)可應(yīng)用于表達(dá)差異的研究。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序比其他研究方法有哪些優(yōu)勢(shì)?轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序具有以下優(yōu)勢(shì):(1)可以直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準(zhǔn)確度,同時(shí)不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號(hào)帶來(lái)的交叉反應(yīng)和背景噪音問(wèn)題;(2)靈敏度高,可以檢測(cè)細(xì)胞中少至幾個(gè)拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本;(3)可以對(duì)任意物種進(jìn)行全基因組分析,無(wú)需預(yù)先設(shè)計(jì)特異性探針,因此無(wú)需了解物種基因信息,能夠直接對(duì)任何物種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,同時(shí)能夠檢測(cè)未知基因,發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本,并準(zhǔn)確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)及cSNP,UTR區(qū)域。(4)檢測(cè)范圍廣,高于6個(gè)數(shù)量級(jí)的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍,能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù):Anydeplete技術(shù)首先通過(guò)隨機(jī)引物進(jìn)行一鏈合成,一鏈合成引入核苷酸類似物,用于酶切打斷,二鏈合成同樣引入核苷酸類似物用于保證鏈特異性。然后兩端加上接頭,接頭一條鏈也帶有核苷酸類似物,用于酶切降解。當(dāng)形成單鏈文庫(kù)后,設(shè)計(jì)特異性引物與rRNA形成文庫(kù)結(jié)合,一輪退火延伸,rRNA文庫(kù)形成雙鏈結(jié)構(gòu)。Reverseadaptor上帶有特異的酶切位點(diǎn),當(dāng)形成雙鏈結(jié)構(gòu)酶切位點(diǎn)被識(shí)別,切去接頭,這樣rRNA形成的文庫(kù)不帶有完整的接頭,而其他文庫(kù)帶有完整接頭,通過(guò)PCR擴(kuò)增富積既能得到想要的信息,包含mRNA及LncRNA信息。同樣Anydeplete技術(shù)與10×genomics技術(shù)一樣,包含分子標(biāo)簽,可分析duplication及PCR產(chǎn)生突變位點(diǎn)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一門(mén)在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用領(lǐng)域:農(nóng)林領(lǐng)域:生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,抗逆脅迫機(jī)制,育種,物種保護(hù)研究等;畜牧業(yè):生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,致病機(jī)理研究,肉類及乳制品品質(zhì)研究等;海洋水產(chǎn):生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,漁業(yè)資源,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;微生物:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;生物醫(yī)藥:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,藥物開(kāi)發(fā),個(gè)性化醫(yī)治等;環(huán)境科學(xué):發(fā)酵過(guò)程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危害風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等;食品科學(xué):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開(kāi)發(fā),食品安全監(jiān)檢測(cè)等。轉(zhuǎn)錄組學(xué)有高通量、更精確的數(shù)字信號(hào)。廣東外泌體microRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)主要技術(shù)
轉(zhuǎn)錄組學(xué)廣義上指在某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合。浙江IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析方法
商務(wù)服務(wù)的發(fā)展在一定程度上可以解決企業(yè)發(fā)展痛點(diǎn),能夠創(chuàng)造出良好的創(chuàng)業(yè)土壤,讓企業(yè)專注于重點(diǎn)主營(yíng)業(yè)務(wù),剝離繁瑣的事務(wù)運(yùn)轉(zhuǎn)。商務(wù)服務(wù)也屬于共享經(jīng)濟(jì)的范疇,可以使企業(yè)共享資源和服務(wù),降低成本。文化賦予了銷售獨(dú)特的生命力和吸引力,從精神層面讓用戶產(chǎn)生深度的關(guān)聯(lián)。中華文明傳承五千年,很多文化自古有之,備受文人墨客的青睞。千百年后的人群依舊能因?yàn)橐皇自?shī),穿越到彼時(shí),這就是文化的力量催生了人類“共情”的能力。在文創(chuàng)產(chǎn)品方面,服務(wù)型企業(yè)是蘊(yùn)含著傳統(tǒng)文化基因的禮物是文化服務(wù),是中國(guó)及世界精神文明的象征。所以對(duì)于行業(yè)內(nèi)的無(wú)數(shù)企業(yè)來(lái)說(shuō),這不僅是一個(gè)巨大商機(jī),更是一個(gè)發(fā)展前景。中國(guó)的有限責(zé)任公司(自然)的優(yōu)化處于發(fā)展的重要戰(zhàn)略機(jī)遇期,加強(qiáng)城市文化、商業(yè)的多樣化,促進(jìn)城市平衡發(fā)展,“無(wú)邊界”式融合,才能實(shí)現(xiàn)有限責(zé)任公司(自然)大發(fā)展,真正迎來(lái)可持續(xù)發(fā)展和推廣。浙江IncRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析方法
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