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烈冰科技作為國內(nèi)率先同時(shí)擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺(tái)的測序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商，經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn)，擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn)，實(shí)測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對不同的分選平臺(tái)、建庫方法，實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程；烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。高通量測序?qū)嶒?yàn)平臺(tái)，包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì)，為您的科學(xué)研...

相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題，BD平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測序細(xì)胞量，特殊研究需求的項(xiàng)目，可提供上限40000個(gè)細(xì)胞的捕獲量（單個(gè)樣本）。這個(gè)量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此，對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上，無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說，都會(huì)更實(shí)用。此外針對特殊項(xiàng)目研究，如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞，如粒細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CAR-T細(xì)胞、干細(xì)胞、移植瘤細(xì)胞、骨髓瘤細(xì)胞等，烈冰生BD平臺(tái)也有更好的捕獲效能，滿足您的實(shí)際需求。自2019年起，烈冰生物BD單細(xì)胞測序平臺(tái)已助力發(fā)表近...

烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái)，目前為全國范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù)，BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板，1個(gè)板即對應(yīng)1個(gè)樣本（不混樣的情況下），每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間，而上限可捕獲40000細(xì)胞時(shí)也能獲得較低的雙細(xì)胞率，此外，單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型，有利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究；細(xì)胞可適性高，對細(xì)胞大小（直徑超過40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核）及類型無限制。細(xì)胞捕獲周期較短，能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離，且實(shí)驗(yàn)端捕獲細(xì)胞過程全程可視化進(jìn)行，保障每一例珍貴樣本實(shí)驗(yàn)的成功進(jìn)行，1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到...

為什么需要單細(xì)胞分辨率？ 生物學(xué)就像宇宙一樣。它非常復(fù)雜，有許多獨(dú)特的單體，也就是細(xì)胞。這些細(xì)胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的體系中構(gòu)建并驅(qū)動(dòng)多個(gè)過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣，發(fā)現(xiàn)和定義這些細(xì)胞也需要高分辨率的工具，才能解開促成生物學(xué)復(fù)雜性的基因表達(dá)異質(zhì)性。單細(xì)胞測序能夠在以一個(gè)細(xì)胞為功能單位中開展生物學(xué)研究，闡明具體細(xì)節(jié)，構(gòu)建出一幅更大、更精細(xì)的圖譜，說明導(dǎo)致產(chǎn)生某種外在表型的不同類型的分子和細(xì)胞之間是如何相互作用的：患者為什么會(huì)復(fù)發(fā)？是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺(tái)，5000+項(xiàng)目檢驗(yàn)，真實(shí)可信賴。北京BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)烈冰生物BD...

您的珍貴樣本，可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，基于BD平臺(tái)從原理到效率到通量的多重包容性，使得BD平臺(tái)對實(shí)驗(yàn)過程存在的批次效應(yīng)產(chǎn)生的可能性更小，可在技術(shù)、生物學(xué)、實(shí)驗(yàn)中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結(jié)果，而磁珠的拆分使用和即時(shí)存儲(chǔ)，可增加實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的靈活性，配套的BD Scanner可視化工作流程質(zhì)控，從細(xì)胞鋪板前微孔板空板檢測，到細(xì)胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細(xì)胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程，均實(shí)現(xiàn)BD Scanner的可視化質(zhì)控，讓您的每個(gè)樣本在實(shí)驗(yàn)端全程無憂。烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺(tái)，助力您的深入科學(xué)探究。上海BD VDJ單細(xì)胞...

多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計(jì)算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！十二年測序經(jīng)驗(yàn)，烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼...

烈冰生物為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程： 對于不同用戶和實(shí)驗(yàn)，單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項(xiàng)可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺(tái)（如 BD FACSMelody），是上游樣本富集的良好選擇。此外，我們具備BD Rhapsody單細(xì)胞成像儀提供自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞樣本活性測試，幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細(xì)胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細(xì)胞的計(jì)數(shù)。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜，可在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)輕松移動(dòng)。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)，完成測序數(shù)據(jù)的生物信...

機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí)，往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析，即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況，構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育，但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間，而是一個(gè)虛擬的時(shí)間，是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中，也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時(shí)序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。烈冰單細(xì)胞多組...

單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽，需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷，這對Single Cell分選標(biāo)記、建庫、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高，將會(huì)影響建庫的成功率；計(jì)數(shù)偏低，則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例；而細(xì)胞活率過低，就會(huì)使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器，其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模...

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，截至2022年6月，烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇，從平臺(tái)應(yīng)用比例來看，應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發(fā)展，靶點(diǎn)探索，免疫研究，神經(jīng)發(fā)育，干細(xì)胞分化，植物發(fā)育，退行病變，糖尿病，COVID-19等等研究；從發(fā)表期刊水平來看，烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章，CNS一區(qū)期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Sc...

您的珍貴樣本，可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，基于BD平臺(tái)從原理到效率到通量的多重包容性，使得BD平臺(tái)對實(shí)驗(yàn)過程存在的批次效應(yīng)產(chǎn)生的可能性更小，可在技術(shù)、生物學(xué)、實(shí)驗(yàn)中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結(jié)果，而磁珠的拆分使用和即時(shí)存儲(chǔ)，可增加實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的靈活性，配套的BD Scanner可視化工作流程質(zhì)控，從細(xì)胞鋪板前微孔板空板檢測，到細(xì)胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細(xì)胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程，均實(shí)現(xiàn)BD Scanner的可視化質(zhì)控，讓您的每個(gè)樣本在實(shí)驗(yàn)端全程無憂。烈冰生物全國五大實(shí)驗(yàn)中心，多地部署B(yǎng)D Rahpsody平臺(tái)，助您的樣本更快速抵達(dá)“戰(zhàn)...

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，截至2022年6月，烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇，從平臺(tái)應(yīng)用比例來看，應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發(fā)展，靶點(diǎn)探索，免疫研究，神經(jīng)發(fā)育，干細(xì)胞分化，植物發(fā)育，退行病變，糖尿病，COVID-19等等研究；從發(fā)表期刊水平來看，烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章，CNS一區(qū)期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Sc...

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，截至2022年6月，烈冰生物助力發(fā)表單細(xì)胞文章近40篇，從平臺(tái)應(yīng)用比例來看，應(yīng)用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺(tái)發(fā)文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發(fā)展，靶點(diǎn)探索，免疫研究，神經(jīng)發(fā)育，干細(xì)胞分化，植物發(fā)育，退行病變，糖尿病，COVID-19等等研究；從發(fā)表期刊水平來看，烈冰生物聯(lián)合發(fā)表的單細(xì)胞文章，CNS一區(qū)期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,風(fēng)濕類領(lǐng)域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Sc...

單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽，需要對細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷，這對Single Cell分選標(biāo)記、建庫、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高，將會(huì)影響建庫的成功率；計(jì)數(shù)偏低，則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例；而細(xì)胞活率過低，就會(huì)使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器，其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模...

由于高通量測序?qū)嶒?yàn)方法相關(guān)的測序成本，使得單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴，烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞測序服務(wù)珍視您的每一份樣本，在平臺(tái)搭建前，我們測試評估了BD Rhapsody的性能，與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看，將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上。存儲(chǔ)的cDNA分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測序（每個(gè)細(xì)胞月8700個(gè)讀數(shù)）。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個(gè)細(xì)胞的上樣條件下，每個(gè)細(xì)胞中，來自每個(gè)細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠，這表明微孔之間的串?dāng)_非常小，在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個(gè)或更少細(xì)胞的上樣密度下，多重態(tài)發(fā)生率接近零，...

您的珍貴樣本，可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，首先，該系統(tǒng)的技術(shù)原理是基于cyto-seq的微孔技術(shù)，因此不會(huì)因?yàn)闃颖炯?xì)胞體積太大或懸液背景太雜等問題導(dǎo)致捕獲通道的堵塞進(jìn)而導(dǎo)致樣本的損失；其次，BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)無電子元件，便于攜帶，當(dāng)您的樣本需及時(shí)實(shí)驗(yàn)時(shí)，我們可以“拎包上門”，快速的完成細(xì)胞捕獲部分，不至于珍貴樣本因細(xì)胞活性快速下降帶來的損失；在這，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)對細(xì)胞數(shù)量包容性較好，細(xì)胞懸液上樣量高達(dá)575ul，針對樣本中細(xì)胞數(shù)量較少的組織類型，也能完成整個(gè)項(xiàng)目的細(xì)胞捕獲工作。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺(tái)，5000...

關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類型和樣本制備 ：在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊，獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺(tái)兼容。一般來說，細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨(dú)特的，因此，必須在開始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn)，累積10+物種、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織，且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液，烈...

烈冰生物單細(xì)胞測序服務(wù)，為您提供可視化質(zhì)控系統(tǒng)，保證每次實(shí)驗(yàn)的可靠性：BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能，可在工作流程的不同階段進(jìn)行質(zhì)量控制，如細(xì)胞捕獲率和細(xì)胞多態(tài)率（雙細(xì)胞率）。成像儀指標(biāo)可以確認(rèn)起始細(xì)胞樣本的質(zhì)量，并確認(rèn)微孔板工作流程中每個(gè)步驟的成功完成狀態(tài) ；在細(xì)胞裂解前的步驟中評估細(xì)胞活性；并對通過測序確定的細(xì)胞回收量進(jìn)行可靠估算。利用這些信息，在進(jìn)行高成本的下游測序之前，用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實(shí)驗(yàn)中遇到的問題。這些指標(biāo)允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進(jìn)行跟蹤。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。武漢scRNA單細(xì)胞測序您的珍貴樣...

烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn)組中心，多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng)，為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程，該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng)，對高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲，由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測序（NGS）文庫。之后對文庫進(jìn)行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)（云平臺(tái)）的數(shù)據(jù)可視化分析，實(shí)現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。單細(xì)胞測序技術(shù)提供了單個(gè)細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角?；茨螧D VDJ單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上...

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)，能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn)：一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個(gè)性化基因列表；輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程...

單細(xì)胞測序技術(shù)（Single Cell Sequencing）從一種新興的研究角度，借助已有的高通量測序手段，幫助研究者在樣本中細(xì)胞的異質(zhì)性、免疫微環(huán)境、發(fā)育學(xué)、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析，解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題。這樣一個(gè)新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來支撐。BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備，保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過程中每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟的準(zhǔn)確質(zhì)控。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BD Rhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)，在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對單細(xì)胞測序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的...

機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí)，往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析，即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況，構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育，但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間，而是一個(gè)虛擬的時(shí)間，是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中，也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時(shí)序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。高通量測序技術(shù)...

什么時(shí)候要用到去死細(xì)胞的操作呢？跟進(jìn)烈冰生物多年單細(xì)胞測序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)來看，當(dāng)細(xì)胞懸液進(jìn)行質(zhì)量和活性檢測后，考慮對細(xì)胞活性在50%-70%的懸液進(jìn)行去除死細(xì)胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細(xì)胞大量死亡，可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細(xì)胞比例和狀態(tài)，失真嚴(yán)重，建議重新收集樣本進(jìn)行新的實(shí)驗(yàn)，保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。但需要注意到，去除死細(xì)胞的操作會(huì)損失一定的細(xì)胞數(shù)量，因此希望您在提供樣本時(shí)，盡可能提供足量的細(xì)胞，以備實(shí)驗(yàn)過程中可能存在的細(xì)胞死亡的問題，BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺(tái)對樣本起始細(xì)胞量的要求較低，一般提供10萬個(gè)細(xì)胞以上均可滿足需求，特殊樣本可詳細(xì)咨詢烈冰生物。單...

烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái)，目前為全國范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù)，BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板，1個(gè)板即對應(yīng)1個(gè)樣本（不混樣的情況下），每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間，而上限可捕獲40000細(xì)胞時(shí)也能獲得較低的雙細(xì)胞率，此外，單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型，有利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究；細(xì)胞可適性高，對細(xì)胞大?。ㄖ睆匠^40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核）及類型無限制。細(xì)胞捕獲周期較短，能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離，且實(shí)驗(yàn)端捕獲細(xì)胞過程全程可視化進(jìn)行，保障每一例珍貴樣本實(shí)驗(yàn)的成功進(jìn)行，1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到...

針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞上樣數(shù)，為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好？一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會(huì)存在一些問題。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時(shí)，如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000，上樣細(xì)胞懸液體積勢必增加，在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想（細(xì)胞活性5%、結(jié)團(tuán)率均>5%）的情況下，引入的背景信號會(huì)增加，分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括：cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當(dāng)cell和non-cell無法有效區(qū)分時(shí)，會(huì)使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結(jié)果！當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時(shí)，多細(xì)胞率會(huì)增加，數(shù)據(jù)分析時(shí)，此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢...