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烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測(cè)序行業(yè)，為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù)，先后經(jīng)歷基因芯片時(shí)代、基因測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序時(shí)代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來(lái)，單細(xì)胞測(cè)序進(jìn)入發(fā)展的快車道，烈冰作為國(guó)內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)雙平臺(tái)的公司，依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累，烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚(yú)、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種，皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型，100+細(xì)胞類型，1000+靶標(biāo)基因，10000+樣本處理經(jīng)驗(yàn)。單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序主要包...

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個(gè)階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點(diǎn)陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學(xué)價(jià)值。每一個(gè)部分都不可或缺，其結(jié)果都對(duì)后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計(jì)。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細(xì)胞的原始數(shù)據(jù)過(guò)濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負(fù)荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進(jìn)行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達(dá)矩陣。單細(xì)胞組學(xué)...

烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，可實(shí)現(xiàn)零代碼操作、簡(jiǎn)單方便：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器的操作簡(jiǎn)單，不需要命令行操作。簡(jiǎn)單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等；3D立體展示，文章動(dòng)圖先人一步：?jiǎn)渭?xì)胞瀏覽器針對(duì)t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。烈冰生物首批引進(jìn) Chromium X 平臺(tái)，開(kāi)啟百萬(wàn)級(jí)通...

相對(duì)于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問(wèn)題，BD和10X這兩個(gè)平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1-6K不等的測(cè)序細(xì)胞量，這個(gè)量級(jí)的測(cè)序細(xì)胞量已經(jīng)可以說(shuō)能夠完全覆蓋絕大部分組織的SingleCell群體類型。因此，這兩種技術(shù)對(duì)于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上，無(wú)論是從細(xì)胞數(shù)量上來(lái)說(shuō)還是表達(dá)檢測(cè)可靠性來(lái)說(shuō)，都會(huì)更實(shí)用。同時(shí)依托RandomCellLabel技術(shù)，使得其對(duì)于NovaSeq、HiSeqXTen、Hiseq4000等設(shè)備存在的Indexhooping現(xiàn)象，相對(duì)于Smart-Seq數(shù)據(jù)來(lái)說(shuō)，影響幾乎可以忽略不計(jì)（10XGenomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測(cè)試結(jié)果，顯示無(wú)影響。烈冰測(cè)序...

SingleCellSequencing技術(shù)，即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)（NGS，NextGenerationSequencing）分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息，從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問(wèn)題來(lái)了，如何獲得單個(gè)細(xì)胞？如果無(wú)法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的；如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞？單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬(wàn)級(jí)別以上，如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過(guò)小精確度不足；如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞？單細(xì)胞測(cè)序成本非常高，尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候，如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高，技術(shù)根本無(wú)法普及。所以，正因?yàn)檫@些問(wèn)題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)...

基因測(cè)序是基因檢測(cè)的方法之一，其又叫基因譜測(cè)序，是國(guó)際上公認(rèn)的一種基因檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次顛覆性的改變，一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定，被稱為下一代測(cè)序技術(shù)(nextgenerationsequencing)，足見(jiàn)其劃時(shí)代的改變，同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測(cè)序(deepsequencing)?；驕y(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用，可以說(shuō)，基因測(cè)序技術(shù)將是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。單細(xì)胞組學(xué)通過(guò)一系列測(cè)序技術(shù)實(shí)現(xiàn)高分辨檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞水平表達(dá)譜,以解析細(xì)胞異質(zhì)性及其功能表型。西安BD Rhapso...

細(xì)胞是構(gòu)成生命的基礎(chǔ)單元，迅速發(fā)展的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)為在單細(xì)胞層面研究細(xì)胞功能及其背后的基因調(diào)控機(jī)制提供了重要的技術(shù)手段，單細(xì)胞測(cè)序可用于檢測(cè)多種不同的組學(xué)種類，包括轉(zhuǎn)錄組、染色質(zhì)開(kāi)放組、DNA甲基化組、組蛋白修飾組等等，對(duì)不同組學(xué)技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析有助于更地刻畫(huà)細(xì)胞內(nèi)的基因調(diào)控狀態(tài)、揭示調(diào)控機(jī)制。然而，與傳統(tǒng)的bulk數(shù)據(jù)相比，單細(xì)胞數(shù)據(jù)具有規(guī)模大、噪聲高、異構(gòu)性強(qiáng)等特點(diǎn)，如何通過(guò)開(kāi)發(fā)新的計(jì)算方法實(shí)現(xiàn)對(duì)這些寶貴數(shù)據(jù)的有效利用已成為當(dāng)今生物信息學(xué)領(lǐng)域關(guān)注的重點(diǎn)與熱點(diǎn)。隨著單細(xì)胞多組學(xué)的不斷進(jìn)步, 研究者將有機(jī)會(huì)在單細(xì)胞分辨率下進(jìn)一步理解個(gè)體發(fā)育以及疾病發(fā)展機(jī)制。溫州scRNA單細(xì)胞多組學(xué)...

所謂的高通量測(cè)序技術(shù)，又名大規(guī)模平行測(cè)序，是將DNA（或者cDNA）隨機(jī)片段化、加接頭，制備測(cè)序文庫(kù)，通過(guò)對(duì)文庫(kù)中數(shù)以萬(wàn)計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng)，檢測(cè)對(duì)應(yīng)的信號(hào)并獲取序列信息。與傳統(tǒng)測(cè)序法相比，高通量測(cè)序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì)，又快（兩天）又多（數(shù)百萬(wàn)克?。?，成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序是一個(gè)系統(tǒng)的工程，開(kāi)展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評(píng)估它提供的見(jiàn)解是否與您的研究問(wèn)題相匹配，如果匹配，實(shí)驗(yàn)過(guò)程如何規(guī)劃，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇，樣本如何制備，數(shù)據(jù)如何分析等等，而在這一切開(kāi)始之前，我們的服務(wù)就已經(jīng)開(kāi)始了，從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持，我們開(kāi)通全線對(duì)接渠道，幫助您快速定位項(xiàng)目訴求，...

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時(shí)，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計(jì)算出來(lái)的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進(jìn)行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測(cè)序深度標(biāo)化到同一水平，從而避免因測(cè)序深度差異導(dǎo)致的基因檢測(cè)數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序主要包含細(xì)胞分離、文庫(kù)構(gòu)建、高通量測(cè)序和生物...

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽，需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)行準(zhǔn)確判斷，這對(duì)SingleCell分選標(biāo)記、建庫(kù)、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高，將會(huì)影響建庫(kù)的成功率；計(jì)數(shù)偏低，則會(huì)顯著提高雙細(xì)胞的比例；而細(xì)胞活率過(guò)低，就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過(guò)程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器，其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式...

機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細(xì)胞會(huì)從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時(shí)，往往會(huì)經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導(dǎo)致一些基因被“沉默”，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時(shí)序分析可以讓我們?cè)诓恍枰兓那闆r下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時(shí)序分析，即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時(shí)間的變化情況，構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育，但這里的時(shí)間并不是真時(shí)間，而是一個(gè)虛擬的時(shí)間，是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個(gè)樣本中，也會(huì)存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此，不論測(cè)定了多少樣本，我們都可以采用擬時(shí)序分析對(duì)樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。隨著組學(xué)新...

單細(xì)胞測(cè)序是指針對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，可精確地描述每一個(gè)細(xì)胞的狀態(tài)，在異質(zhì)性發(fā)育過(guò)程中具有不可忽視的應(yīng)用價(jià)值。然而，單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息，對(duì)于揭示發(fā)育過(guò)程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性?？臻g轉(zhuǎn)錄組測(cè)序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測(cè)序，可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況。空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的加入，無(wú)疑讓單細(xì)胞測(cè)序如虎添翼，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。目前單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)仍然處于技術(shù)探索及高通量開(kāi)發(fā)階段,但應(yīng)用單細(xì)胞多組學(xué)分析是研究發(fā)展的必然趨勢(shì)。廈門single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序服務(wù)其實(shí)，空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了，目前...

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求，首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果，存在各種情況的序列污染。因此序列過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過(guò)測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來(lái)表征，即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1%/0.1%以下的比例。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性，為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定準(zhǔn)確和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。首先 出現(xiàn)的單細(xì)胞多組學(xué)方法就是將轉(zhuǎn)錄組與其他組學(xué)技術(shù)結(jié)合。廈門烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)平臺(tái)烈冰科技作為國(guó)內(nèi)同時(shí)擁有10XGenom...

分子檢測(cè)型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)中也有一些集中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。功能研究型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù),結(jié)合了強(qiáng)大的CRISPR基因編輯技術(shù),從而可以深度挖掘基因表達(dá)調(diào)控與細(xì)胞功能以及命運(yùn)決定之間的因果關(guān)系。在未來(lái),為了更系統(tǒng)地研究多層組學(xué)之間的互動(dòng)關(guān)系對(duì)細(xì)胞命運(yùn)的影響,一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)的策略會(huì)繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個(gè)組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展.另一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)會(huì)轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測(cè)序分析和功能驗(yàn)證同時(shí)進(jìn)行的方法,這種探究因果關(guān)系的策略對(duì)于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關(guān)鍵因子和分子網(wǎng)絡(luò)模塊十分重要。單細(xì)胞技術(shù)從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在，研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄...

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還可以實(shí)現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您！單一的轉(zhuǎn)錄本研究不能體現(xiàn)生命進(jìn)程的變化，因此多組學(xué)聯(lián)合分析成為解析生命進(jìn)程的有力工具。北京scRNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持機(jī)體為...

單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果動(dòng)輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對(duì)于分析平臺(tái)和分析能力有著很高的要求，首先針對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會(huì)出現(xiàn)低質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果，存在各種情況的序列污染。因此序列過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估就會(huì)變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過(guò)測(cè)序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來(lái)表征，即堿基測(cè)序結(jié)果的錯(cuò)誤率在1%/0.1%以下的比例。理想的測(cè)序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性，為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定準(zhǔn)確和功能分析打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。烈冰測(cè)序數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，不依賴已有物種信息，可研究非模式物種，針對(duì)不同平臺(tái)的數(shù)據(jù)，制定多套流程。濟(jì)南scRNA單細(xì)胞多組學(xué)平臺(tái)烈冰...

分子檢測(cè)型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)中也有一些集中于探究單細(xì)胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關(guān)聯(lián)。功能研究型單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù),結(jié)合了強(qiáng)大的CRISPR基因編輯技術(shù),從而可以深度挖掘基因表達(dá)調(diào)控與細(xì)胞功能以及命運(yùn)決定之間的因果關(guān)系。在未來(lái),為了更系統(tǒng)地研究多層組學(xué)之間的互動(dòng)關(guān)系對(duì)細(xì)胞命運(yùn)的影響,一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)的策略會(huì)繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結(jié)合其他多個(gè)組學(xué)的三組學(xué)甚至四組學(xué)方向發(fā)展.另一方面,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)會(huì)轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測(cè)序分析和功能驗(yàn)證同時(shí)進(jìn)行的方法,這種探究因果關(guān)系的策略對(duì)于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關(guān)鍵因子和分子網(wǎng)絡(luò)模塊十分重要。在單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)的支持下,早期妊娠母胎界面的異質(zhì)性問(wèn)題得到了...

BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng)，可以對(duì)不同熒光標(biāo)記的細(xì)胞進(jìn)行檢測(cè)并計(jì)數(shù)。在進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估之前，首先要將細(xì)胞的培養(yǎng)體系更換成上機(jī)所需的Buffer。在這個(gè)過(guò)程中，需要進(jìn)行多次離心、重懸操作，烈冰Novelbio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)推薦采用水平轉(zhuǎn)子離心機(jī)來(lái)進(jìn)行這步操作。這種離心機(jī)可以有效減少細(xì)胞在多次更換Buffer過(guò)程中的損失，尤其是對(duì)于細(xì)胞量較少的樣本來(lái)說(shuō)，顯得非常有必要。更換完Buffer之后，還需要將細(xì)胞進(jìn)行過(guò)篩操作，去除較大的細(xì)胞團(tuán)，獲得較為純凈的單細(xì)胞懸液。單細(xì)胞多組學(xué) 測(cè)序技術(shù)會(huì)轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學(xué)測(cè)序分析和功能驗(yàn)證同時(shí) 進(jìn)行的方法。北京烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持其實(shí)，...

當(dāng)蜂巢孔內(nèi)同時(shí)落入細(xì)胞和磁珠后，接下去可以往BDCartridge板中加入細(xì)胞裂解液對(duì)細(xì)胞進(jìn)行裂解，使細(xì)胞內(nèi)的RNA與磁珠上的標(biāo)簽進(jìn)行結(jié)合，完成每個(gè)細(xì)胞內(nèi)RNA的捕獲和標(biāo)記。這時(shí)，再將捕獲了RNA的磁珠進(jìn)行回收，待所有質(zhì)控結(jié)果確認(rèn)通過(guò)后就可以進(jìn)行后續(xù)的RNA反轉(zhuǎn)錄、cDNA第二鏈合成等實(shí)驗(yàn)操作。而B(niǎo)DCartridge板則需要再進(jìn)行一次成像，獲得磁珠收集后的掃描圖，判斷磁珠是否已經(jīng)被有效收集。根據(jù)每一步的質(zhì)控結(jié)果，烈冰科技（NovelBio）單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)團(tuán)隊(duì)會(huì)根據(jù)單細(xì)胞分選的實(shí)驗(yàn)結(jié)果生成實(shí)驗(yàn)總結(jié)報(bào)告，判斷每一步驟是否通過(guò)質(zhì)控，并得到捕獲的單細(xì)胞數(shù)量以及雙細(xì)胞比例，對(duì)整個(gè)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行總結(jié)評(píng)估。若所...

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)（SingleCellSequencing）從一種新興的研究角度，借助已有的高通量測(cè)序手段，幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學(xué)、免疫學(xué)以及其他領(lǐng)域中進(jìn)行單細(xì)胞層面的數(shù)據(jù)解析，解決了BulkPopulationSequencing所無(wú)法解決的問(wèn)題。這樣一個(gè)新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實(shí)驗(yàn)手段來(lái)支撐。BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備，保證了從單細(xì)胞懸液質(zhì)量評(píng)估到單細(xì)胞分選標(biāo)記過(guò)程中每一個(gè)實(shí)驗(yàn)步驟的完善質(zhì)控。NovelBio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)借助BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)，在實(shí)驗(yàn)實(shí)施層面對(duì)單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果的可靠性提供了強(qiáng)有力的保證。繼單細(xì)胞...

對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言，常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜，在此基礎(chǔ)上再開(kāi)展后續(xù)各項(xiàng)分析，并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類（cell cluster）為討論對(duì)象，而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象，因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格，但是單細(xì)胞測(cè)序，特別是目的為圖譜研究時(shí)，需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細(xì)胞圖譜信息。因此，單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù)，不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲、建庫(kù)、測(cè)序，以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù)，單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí)，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準(zhǔn)確性。目前單細(xì)胞...

SingleCellSequencing技術(shù)，即利用優(yōu)化后的高通量測(cè)序技術(shù)（NGS，NextGenerationSequencing）分析每一個(gè)單個(gè)細(xì)胞的序列信息，從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問(wèn)題來(lái)了，如何獲得單個(gè)細(xì)胞？如果無(wú)法獲得單個(gè)細(xì)胞這一切都是不成立的；如何獲得大批量的單個(gè)細(xì)胞？單個(gè)組織細(xì)胞群體通常在百萬(wàn)級(jí)別以上，如果被檢測(cè)的測(cè)序細(xì)胞數(shù)量過(guò)小精確度不足；如何低成本地獲得大批量單個(gè)細(xì)胞？單細(xì)胞測(cè)序成本非常高，尤其是需要測(cè)2000~3000個(gè)以上的細(xì)胞的時(shí)候，如果單個(gè)細(xì)胞的分選成本也很高，技術(shù)根本無(wú)法普及。所以，正因?yàn)檫@些問(wèn)題的存在使得高通量測(cè)序在單個(gè)...

烈冰科技作為國(guó)內(nèi)同時(shí)擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺(tái)的測(cè)序服務(wù)商及云計(jì)算服務(wù)供應(yīng)商，經(jīng)過(guò)多年實(shí)戰(zhàn)，擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗(yàn)，實(shí)測(cè)BDRhapsody對(duì)能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對(duì)不同的分選平臺(tái)、建庫(kù)方法，實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程；烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)平臺(tái)，包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等，配合一支來(lái)自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊(duì)，為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航。...

未來(lái),單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,一方面將集中在對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化和新方法的開(kāi)發(fā).現(xiàn)有技術(shù)的優(yōu)化不僅包括建庫(kù)手段、測(cè)序技術(shù)和算法工具等方面,還包括優(yōu)化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)流程以及提升實(shí)驗(yàn)效率.為了更好地檢測(cè)到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物、化學(xué)和物理等多學(xué)科中尋找解決方案.此外,新的計(jì)算方法和分析工具能幫助研究者越過(guò)一些實(shí)驗(yàn)限制,發(fā)現(xiàn)更多新奇的生物過(guò)程.例如,擬時(shí)序分析(pseudotimetrajectory)將有助于人們理解早期胚胎發(fā)育的細(xì)胞分化軌跡.新方法則可以更多地關(guān)注目前未能檢測(cè)到的一些重要的基因表達(dá)調(diào)控層面,如DNA三維結(jié)構(gòu)、非編碼RNA和胞內(nèi)蛋白等.另一方面,目前的單細(xì)胞多...

2016年發(fā)表的DR-seq和G&T-seq技術(shù),實(shí)現(xiàn)在單細(xì)胞內(nèi)同時(shí)進(jìn)行基因組和轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序分析,使得研究人員能夠在分析細(xì)胞間基因組差異和基因表達(dá)異質(zhì)性的同時(shí),進(jìn)一步理解基因組序列差異、拷貝數(shù)變異與轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性之間的關(guān)系.隨后在同一個(gè)單細(xì)胞內(nèi),基于轉(zhuǎn)錄組、染色質(zhì)可及性、染色質(zhì)構(gòu)象、DNA拷貝數(shù)、DNA甲基化、蛋白質(zhì)豐度或者空間狀態(tài)等整合分析的多組學(xué)方法也相繼出現(xiàn)。相較于利用不同的單細(xì)胞單組學(xué)測(cè)序方法從一類細(xì)胞中分別獲取轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀遺傳組等進(jìn)行分析,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)可以從同一個(gè)單細(xì)胞中同時(shí)獲取多種組學(xué)數(shù)據(jù),可以更好地反映細(xì)胞在特定狀態(tài)下各組學(xué)間的關(guān)聯(lián)以及復(fù)雜的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。單細(xì)胞多組...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)都是獲得基因表達(dá)情況的重要工具，從生物學(xué)角度上看，轉(zhuǎn)錄組表示了基因表達(dá)的中間狀態(tài)，可以反映諸如轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的機(jī)理；而蛋白質(zhì)是生物體直接的功能執(zhí)行者，因而對(duì)其表達(dá)水平的研究有著不可替代的優(yōu)勢(shì)。要探究生物體疾病機(jī)理、脅迫機(jī)制，精確研究重要基因的表達(dá)模式和調(diào)控機(jī)理，只有聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)表達(dá)量數(shù)據(jù)對(duì)生物樣本進(jìn)行系統(tǒng)研究，才能真正觀察到mRNA-蛋白質(zhì)關(guān)聯(lián)性，進(jìn)而從整體上解釋生物學(xué)問(wèn)題。單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序技術(shù)是在單細(xì)胞分辨率下精確分析細(xì)胞異質(zhì)性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的新技術(shù)。北京single cell 單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持冰凍切片的空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在RNA捕獲、文庫(kù)構(gòu)建方面，需要將...

空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個(gè)階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點(diǎn)陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學(xué)價(jià)值。每一個(gè)部分都不可或缺，其結(jié)果都對(duì)后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計(jì)。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細(xì)胞的原始數(shù)據(jù)過(guò)濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負(fù)荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進(jìn)行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達(dá)矩陣。烈冰測(cè)序服...

對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序而言，常常需要先構(gòu)建細(xì)胞圖譜，在此基礎(chǔ)上再開(kāi)展后續(xù)各項(xiàng)分析，并且數(shù)據(jù)分析時(shí)以細(xì)胞聚類（cell cluster）為討論對(duì)象，而不是像常規(guī)Bulk測(cè)序一樣以組別為分析對(duì)象，因此單細(xì)胞測(cè)序項(xiàng)目對(duì)樣本入組要求沒(méi)有Bulk測(cè)序那樣嚴(yán)格，但是單細(xì)胞測(cè)序，特別是目的為圖譜研究時(shí)，需要通過(guò)提高樣本復(fù)雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構(gòu)建某一疾病類型、群體細(xì)胞圖譜信息。因此，單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)時(shí)首先需要保證生物學(xué)重復(fù)，不同樣本來(lái)源的樣本建議單獨(dú)進(jìn)行細(xì)胞解離和捕獲、建庫(kù)、測(cè)序，以保證捕獲到足夠的細(xì)胞數(shù)，單個(gè)樣本分別捕獲細(xì)胞時(shí)，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準(zhǔn)確性。，從多組學(xué)...

烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺(tái)致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學(xué)意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究，加速科研進(jìn)程！此外，烈冰生信團(tuán)隊(duì)根據(jù)豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)為用戶量身打造了一款單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果解讀的神兵利器——單細(xì)胞瀏覽器（SingleCellBrowser），不僅可以將海量復(fù)雜的結(jié)果文件可視化，還可以實(shí)現(xiàn)分析結(jié)果的三維立體化的展示呈現(xiàn)。專業(yè)的生信代碼交給專業(yè)的烈冰，專業(yè)的生物學(xué)意義交給專業(yè)的您！在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域，將轉(zhuǎn)錄組與蛋白質(zhì)結(jié)合的代表性例子只有單細(xì) 胞RＮＡ測(cè)序方法。寧波上海烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序服務(wù)相對(duì)于Sm...

BDRhapsody單細(xì)胞分選系統(tǒng)集成了熒光顯微成像系統(tǒng)，可以對(duì)不同熒光標(biāo)記的細(xì)胞進(jìn)行檢測(cè)并計(jì)數(shù)。在進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估之前，首先要將細(xì)胞的培養(yǎng)體系更換成上機(jī)所需的Buffer。在這個(gè)過(guò)程中，需要進(jìn)行多次離心、重懸操作，烈冰Novelbio單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)推薦采用水平轉(zhuǎn)子離心機(jī)來(lái)進(jìn)行這步操作。這種離心機(jī)可以有效減少細(xì)胞在多次更換Buffer過(guò)程中的損失，尤其是對(duì)于細(xì)胞量較少的樣本來(lái)說(shuō)，顯得非常有必要。更換完Buffer之后，還需要將細(xì)胞進(jìn)行過(guò)篩操作，去除較大的細(xì)胞團(tuán)，獲得較為純凈的單細(xì)胞懸液。單細(xì)胞技術(shù)從 2009 年發(fā)展到現(xiàn)在，研究范圍不再局限于轉(zhuǎn)錄組，擴(kuò)展到了基因組、免疫組、蛋白組等多組學(xué)水平。武漢...