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蛋白質(zhì)翻譯后修飾的重要性：翻譯后修飾可以發(fā)生在蛋白質(zhì)生命周期的任何階段。例如，許多蛋白質(zhì)在翻譯完成后不久就被修飾，以介導(dǎo)適當(dāng)?shù)牡鞍踪|(zhì)折疊或穩(wěn)定，或?qū)⑿律鞍踪|(zhì)引導(dǎo)到不同的細(xì)胞區(qū)室（例如，細(xì)胞核、膜）。折疊和定位完成后發(fā)生其他修飾，以刺激或滅活催化活性或以其他方...

蛋白質(zhì)組學(xué)：常用技術(shù)：靶向蛋白組（PRM靶向蛋白/肽段定量），修飾蛋白組學(xué)（定量磷酸化修飾組學(xué)、定量糖基化修飾蛋白組學(xué)、定量乙?；揎椀鞍捉M學(xué)和定量泛素化修飾蛋白組學(xué)），互作蛋白組學(xué)（代謝物與蛋白互作研究）。什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測(cè)？大概可以測(cè)到多少的蛋白種類(lèi)...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)：翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對(duì)翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價(jià)加工的過(guò)程。它通過(guò)在一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基加上修飾基團(tuán)，可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)，進(jìn)而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài)、亞...

甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域：基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機(jī)理機(jī)制，疾病分型，個(gè)性化治理等；生物醫(yī)藥：藥物作用機(jī)理，藥效評(píng)價(jià)，藥物開(kāi)發(fā)等；農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機(jī)制，生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制，育種保護(hù)研究等；畜牧業(yè)：肉類(lèi)及乳品質(zhì)研究，致病機(jī)理研究等；微生物領(lǐng)域：致...

磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：在有機(jī)體內(nèi)，磷酸化是蛋白翻譯后修飾中比較普遍的共價(jià)修飾形式，同時(shí)也是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。磷酸化對(duì)蛋白質(zhì)功能的正常發(fā)揮起著重要的調(diào)節(jié)作用，該過(guò)程是由蛋白質(zhì)激酶（Kinase）催化的把ATP或GTP的γ位磷酸基轉(zhuǎn)移到底...

代謝組學(xué)有哪些特點(diǎn)？(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學(xué)的末端，更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實(shí)情況，因此，在多數(shù)生物表型研究上更加適用。(2) 常規(guī)代謝組學(xué)只關(guān)注內(nèi)源性化合物，也有使用代謝組學(xué)技術(shù)測(cè)定外源性化合物的。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病、毒性、基因修飾...

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用：蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)，包括對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)模式和蛋白質(zhì)組功能模式的研究。蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展對(duì)尋找疾病的診斷標(biāo)志、篩選藥物靶點(diǎn)、毒理學(xué)研究等有重要意義，也因...

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTMs）是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后的化學(xué)修飾過(guò)程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTMs）通過(guò)給蛋白質(zhì)添加磷酸酯、乙酸酯、酰胺基或甲基等官能團(tuán)增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性，并影響正常細(xì)胞生物學(xué)和發(fā)病機(jī)理的幾乎所有方面。蛋白質(zhì)翻譯后修飾...

定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法學(xué)背景和意義：從生命活動(dòng)的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學(xué)的主要手段。而這些研究往往離不開(kāi)對(duì)細(xì)胞、組織中含有蛋白質(zhì)種類(lèi)和表達(dá)量的研究。對(duì)處不同時(shí)期、不同條件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平變化的研究...

代謝組學(xué)什么類(lèi)型的樣本更適合，樣本采集需要注意什么？絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見(jiàn)的樣本主要有：臨床和動(dòng)物的血清、血漿、尿液、糞便、各類(lèi)組織、體液；細(xì)胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液；植物的根、莖、葉、花等。代謝每時(shí)每刻都在發(fā)生變化，我們需...

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù)：乙?；揎検求w內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。此外，還存在大量的非組蛋白乙?；揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù)采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對(duì)蛋白乙?；b定...

常用的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法有以下幾類(lèi)：非標(biāo)記（labelfree）的定量蛋白組學(xué)技術(shù)：Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析，無(wú)需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較...

甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域：基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機(jī)理機(jī)制，疾病分型，個(gè)性化治理等；生物醫(yī)藥：藥物作用機(jī)理，藥效評(píng)價(jià)，藥物開(kāi)發(fā)等；農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機(jī)制，生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制，育種保護(hù)研究等；畜牧業(yè)：肉類(lèi)及乳品質(zhì)研究，致病機(jī)理研究等；微生物領(lǐng)域：致...

RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)的應(yīng)用：RNA-Seq即對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序和分析。一般來(lái)說(shuō)在研究所會(huì)委托公司測(cè)序得到數(shù)據(jù)自己進(jìn)行后續(xù)的生信分析（質(zhì)控，mapping，差異基因表達(dá)分析，SNV分析等）。RNA-Seq有著巨大的應(yīng)用前景。在不同背景下比較mRNA水平同一物種，...

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：泛素是一種由76個(gè)氨基酸組成的多肽，在真核生物中高度保守，可通過(guò)異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴(lài)氨酸殘基的氨基進(jìn)行共價(jià)連接。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記，泛素用親和標(biāo)簽（通常為6xHis）進(jìn)行標(biāo)記，并通過(guò)鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為A...

泛素化修飾PRM定量驗(yàn)證：原理： 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位，調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種...

定量磷酸化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學(xué)：蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化是重要的翻譯后修飾，它與信號(hào)傳導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)理等諸多生物學(xué)問(wèn)題有密切關(guān)系。研究蛋白質(zhì)磷酸化對(duì)闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義。將磷酸化肽段TiO2富集技術(shù)和iTRAQ/TMT/Lable free技術(shù)相結(jié)合，實(shí)...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾：蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (Protein translational modifications，PTMs) 通過(guò)功能基團(tuán)或蛋白質(zhì)的共價(jià)添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個(gè)蛋白質(zhì)的降解來(lái)增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞...

宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)也稱(chēng)為環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學(xué)，指從整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時(shí)期菌群群體全部基因轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律，以揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應(yīng)機(jī)制，探索環(huán)境與微生物之間的相互作用機(jī)理。其適用范圍包括人體微生態(tài)、環(huán)境、工業(yè)、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)以生態(tài)環(huán)境中...

糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：蛋白質(zhì)的糖基化具有異質(zhì)性。不同的糖鏈可以連接到同一位點(diǎn)上，不同位點(diǎn)可以連接到同一蛋白質(zhì)上的不同糖鏈上。糖基化的異質(zhì)性嚴(yán)重阻礙了糖蛋白的分離和分析。不同糖類(lèi)型的相同蛋白質(zhì)，在電泳上會(huì)出現(xiàn)分散的條帶，導(dǎo)致信號(hào)分散。此外，對(duì)低豐度蛋白質(zhì)的識(shí)別性...

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個(gè)細(xì)胞過(guò)程的重要方式，幾乎在每個(gè)細(xì)胞過(guò)程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對(duì)揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在，這限制了在分析全...

代謝組學(xué)適用范圍：1、體液：血清、血漿、尿液、唾液、膝蓋滑液、腦脊液、卵泡液、牛奶、痰液、舌苔液、膽汁等。2、組織：各種動(dòng)物組織和植物組織。3、細(xì)胞：細(xì)胞及細(xì)胞培養(yǎng)液等。3、微生物：大腸桿菌、鏈球菌等。4、其他：糞便、食糜、腸道內(nèi)容物等。應(yīng)用領(lǐng)域：1、非靶向代...

蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢(shì)：技術(shù)發(fā)展方面：蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存，各有優(yōu)勢(shì)和的特點(diǎn)，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強(qiáng)調(diào)各種方法間的整合和互補(bǔ)，以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要...

代謝組學(xué)的概念：代謝組學(xué)的概念來(lái)源于代謝組，代謝組是指某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物，代謝組學(xué)則是對(duì)某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時(shí)進(jìn)行定性和定量分析的一門(mén)新學(xué)科。它是以組群指標(biāo)分析為基礎(chǔ)，以高通量檢測(cè)和數(shù)據(jù)處理...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點(diǎn)分析時(shí)應(yīng)該注意些什么問(wèn)題？覆蓋率：覆蓋率越高，檢測(cè)和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大。修飾位點(diǎn)的占有率：被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低，則檢測(cè)到修飾肽的機(jī)會(huì)會(huì)隨之減少。如果百分比較高（> 30％），則有助于識(shí)別修飾位點(diǎn)。棕櫚?；鞍?..

iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)：iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這種技術(shù)同TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù)相似，可研究不同病理?xiàng)l件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品...

單細(xì)胞RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)工作流程：?jiǎn)渭?xì)胞RNA測(cè)序等高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)通常從針對(duì)不同瘤和組織類(lèi)型（解離、分選和分離細(xì)胞等）量身定制的實(shí)驗(yàn)工作流程開(kāi)始，然后產(chǎn)生可以比對(duì)的序列，量化、質(zhì)量控制(QC)過(guò)濾和以不同方式標(biāo)準(zhǔn)化，以實(shí)現(xiàn)許多下游計(jì)算分析，例如聚...

蛋白質(zhì)組學(xué)研究?jī)?nèi)容：1.蛋白質(zhì)鑒定：可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合相關(guān)技術(shù)，利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定研究。2.翻譯后修飾：很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的...

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序推薦的測(cè)序數(shù)據(jù)量？轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所需數(shù)據(jù)量與所研究物種的基因組大小有關(guān)，基因組越大，則所需數(shù)據(jù)量越大。按照我們的經(jīng)驗(yàn)來(lái)說(shuō)：常規(guī)物種一般建議6G數(shù)據(jù)即可；基因組較大的物種推薦8G以上數(shù)據(jù)，比如：小麥建議10G數(shù)據(jù)起，甘蔗、甘薯建議至少8G數(shù)據(jù)。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序必...

非靶向代謝組學(xué)：非靶向代謝組學(xué)可用于檢測(cè)生物體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化，通過(guò)數(shù)據(jù)處理，多維統(tǒng)計(jì)和數(shù)學(xué)建模來(lái)分析生物擾動(dòng)下的代謝指紋圖譜。尋找兩組間發(fā)生明顯變化的差異代謝物，富集差異代謝通路， 獲得整個(gè)生物體的代謝輪廓。 技術(shù)優(yōu)勢(shì)： 1、代謝組學(xué)能放大基因...