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RNA-Seq，是基于新一代測序技術的轉錄組學研究方法：首先提取生物樣品的全部轉錄的RNA并進行mRNA富集，然后反轉錄為cDNA后進行的新一代高通量測序，在此基礎上進行片段的拼接組裝，從而可得到一個個的轉錄本，進而可以形成對該生物樣品當前發(fā)育狀態(tài)的基因表達狀...

什么是轉錄組測序？轉錄組廣義上指在某一生理條件下，細胞內所有轉錄組產物的組合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狹義上指所有mRNA的組合。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和，主要包括mRNA和ncRNA。轉錄組...

蛋白質組學研究這樣做：蛋白質組與基因組相對應，也是一個整體的概念，隨著基因組學研究的不斷深入，蛋白質組學已逐漸成為研究熱點，對蛋白組學的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質，但探究成千上萬的蛋白質特性也是一個重大的技術挑戰(zhàn)。蛋白質組（Proteome）指的是...

蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題？覆蓋率：覆蓋率越高，檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率：被修飾的蛋白質的百分比低，則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高（> 30％），則有助于識別修飾位點。棕櫚?；鞍?..

蛋白質組學研究策略有什么？“自頂向下”策略并不依賴于蛋白酶的酶切，而是直接鑒定完整蛋白質，在翻譯后修飾和蛋白質同素異構體鑒定方面有一些潛在的優(yōu)勢?？墒窃摬呗缘娜毕菔堑鞍踪|在氣相中分離、電離及碎裂都十分困難。而鳥管法蛋白質組學由于將蛋白質酶解成肽段，使其在氣相中...

代謝組學研究方法：代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯(lián)用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。...

轉錄組及轉錄組測序（RNA-seq）：轉錄組即特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組測序（RNA-seq）主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的mRNA的表達量，進而對相關基因和表型的關系進...

蛋白質翻譯后修飾在蛋白質中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題？覆蓋率：覆蓋率越高，檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率：被修飾的蛋白質的百分比低，則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高（> 30％），則有助于識別修飾位點。棕櫚?；鞍?..

代謝組學樣本收集注意事項：（1）血液離開動物或人體后，應盡快開展血清、血漿的分離，并嚴格按照操作說明進行。（2）采集到的血清為黃色透明液體、血漿為淡黃色半透明液體，如果發(fā)現(xiàn)樣本中是紅色，說明在已經發(fā)生了了溶血現(xiàn)象，樣本需重新制備。（3）血清與血漿的主要區(qū)別在于...

轉錄組及轉錄組測序（RNA-seq）：轉錄組即特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組測序（RNA-seq）主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的mRNA的表達量，進而對相關基因和表型的關系進...

轉錄組學技術路線及研究意義：轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更準確的數(shù)字化信號...

根據(jù)不同的作用位點，蛋白質乙?；揎椃譃椋喊l(fā)生在蛋白N端的乙?；揎?、發(fā)生在蛋白賴氨酸上的乙酰化修飾。前者發(fā)生在90%以上的真核生物新生蛋白上，對于新生蛋白的成熟和細胞定位非常重要，由N乙酰轉移酶（NATs）負責；而后者是一個可逆的過程，主要由賴氨酸乙?；福?..

選擇代謝組學作為科研技術手段的優(yōu)勢有哪些？代謝組學的研究處于生物信息流的中游，介于基因、蛋白質和細胞、組織之間，在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產生和代謝是基因表達的下游產物，生物體液的代謝產物分析能夠更直接，更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代...

iTRAQ/TMT標記定量蛋白質組介紹：iTRAQ/TMT標記定量蛋白質組研究是對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內所有蛋白質進行標記，利用標記試劑中的二級報告離子來對蛋白進行精確鑒定和定量。技術優(yōu)勢：1、適用范圍廣：可檢測到的蛋白除了胞漿蛋白外，...

什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是發(fā)展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環(huán)境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學。代謝組學著重研究...

蛋白質糖基化修飾組學技術服務：糖基化是在酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發(fā)生于內質網和高爾基體等部位。在糖基轉移酶作用下將糖轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基共價結合。蛋白質經過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調節(jié)蛋白質功...

泛素化修飾蛋白組學研究：泛素化修飾蛋白組學是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內80%~85%的蛋白質降解。此外，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質的活性和定位，調控包括細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內的多種細...

什么叫轉錄組學？廣義轉錄組是指生命單元(通常是一種細胞)中所有按基因信息單元轉錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細胞所有轉錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質分子和它們所組成的基因功能網絡以及它們與細胞功能的關系....

轉錄組學的概念：轉錄組是指特定組織或細胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉錄出來的所有RNA的匯合，包括蛋白質編碼的信使RNA和非編碼RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量測序技術也被稱為下一代測序（NGS）技術，推進了基因組學的研究進展。該項新技術...

蛋白質組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用？作為主要研究策略的蛋白質組學:這與題目中的描述更相關些，蛋白質組學是研究中的關鍵方法(甚至是唯1方法)。具體而言，蛋白質組學在此類應用中，更多地用于提供高通量蛋白質定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質組學:事實上，在當前的生...

代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么？根據(jù)不同的檢測要求，需要配合不同的樣本量和樣本采集方法，常規(guī)的方法和單個樣本量如下：(1) 微生物和細胞樣本：細胞迅速猝滅細胞并冷凍保存；單個樣本細胞數(shù)量要求10^6。(2) 動物體液（如尿、血、組織、唾液）：采樣后要迅...

蛋白質翻譯后修飾組學技術原理：首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物，然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進行組分分離以降低樣本復雜程度，然后通過高質量的修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進行富集，之后上樣至液相色譜 - 串聯(lián)質譜中進行分析，通過相應的數(shù)據(jù)庫檢索匹配，一次...

代謝組學什么類型的樣本更適合，樣本采集需要注意什么？絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學研究。常見的樣本主要有：臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液；細胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液；植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發(fā)生變化，我們需...

蛋白組究竟研究的是什么呢？第1，蛋白質定性，或者說大規(guī)模檢測某些蛋白質是否存在于樣品當中；第2，蛋白質定量，也就是大規(guī)模檢測某些蛋白質的含量（包括一定含量與相對含量）；第3，蛋白質翻譯后修飾，這些修飾主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括對這些翻譯...

單細胞轉錄組關鍵步驟：單細胞的分離和捕獲：溫和分離，稀有細胞。轉錄本的捕獲和擴增：RNA測序需要0.1-1.0ug total RNA，捕獲效率10%（5-**NA測序需要1ng DNA，極限稀釋加移液分離單細胞；顯微操作分選單細胞；流式分選帶有表面M...

定量蛋白質組學的方法學背景和意義：從生命活動的直接執(zhí)行者——蛋白質的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究...

circRNA轉錄組學：是一類具有閉合環(huán)狀結構的非編碼RNA分子，沒有5′ 帽子結構和3′ poly（A）結構，主要位于細胞質或儲存于外泌體中，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定且不易降解，已被證明普遍存在于多種真核生物體內。大多數(shù)circRNA是由外顯子環(huán)化而...

藥物代謝和代謝組學區(qū)別：代謝組學與藥物代謝不同是它關注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內源性代謝物。這些代謝物是糖，脂肪，蛋白質，核酸，膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的，是一個龐大的混合物。目的是通過樣本的對比，發(fā)現(xiàn)潛在標志物，指導疾病早期診斷...

轉錄組是特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內的完整轉錄信息的匯合，表示了基因表達的中間狀態(tài)。轉錄組測序可以對所有轉錄物進行分類、確定基因的轉錄結構、量化轉錄物的表達水平。蛋白質是生命功能的直接執(zhí)行者，蛋白組是一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。整合轉錄組學和蛋白...

代謝組學應用方向：腸道菌群代謝組學，運用代謝組學檢測腸菌代謝物的動態(tài)變化，了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài)，直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關系，為疾病的預防，調高宿主的健康水平提供新的思路。經典脂質組學：對生物體、組織或細胞中的脂質以及與其相互作用的分子進...